More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0281 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  100 
 
 		 322 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  95.03 
 
 		 322 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  97.83 
 
 		 322 aa  613  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  94.1 
 
 		 322 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  93.48 
 
 		 322 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0392  malate dehydrogenase  93.48 
 
 		 322 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.208989 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0419  malate dehydrogenase  90.99 
 
 		 322 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  83.7 
 
 		 320 aa  541  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  83.39 
 
 		 320 aa  541  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  83.07 
 
 		 320 aa  537  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  79.31 
 
 		 321 aa  533  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  79.94 
 
 		 320 aa  521  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  78.37 
 
 		 321 aa  521  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3604  malate dehydrogenase, NAD-dependent  81.7 
 
 		 320 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  77.29 
 
 		 333 aa  504  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  79 
 
 		 320 aa  504  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  77.74 
 
 		 320 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  79.62 
 
 		 320 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  79.62 
 
 		 320 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  79 
 
 		 321 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  74.92 
 
 		 320 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  74.92 
 
 		 338 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  78.73 
 
 		 320 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  74.29 
 
 		 320 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2161  malate dehydrogenase, NAD-dependent  77.14 
 
 		 320 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  77.12 
 
 		 320 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  77.12 
 
 		 320 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  74.77 
 
 		 320 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  75.24 
 
 		 320 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2501  malate dehydrogenase, NAD-dependent  76.32 
 
 		 321 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.448823 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  73.04 
 
 		 320 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  74.29 
 
 		 320 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  73.35 
 
 		 320 aa  475  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  74.92 
 
 		 320 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  73.04 
 
 		 320 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  71.61 
 
 		 318 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  69.59 
 
 		 320 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  69.91 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  64.4 
 
 		 316 aa  442  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  68.89 
 
 		 320 aa  441  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  62.46 
 
 		 317 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  62.34 
 
 		 316 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  60.69 
 
 		 318 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  61.2 
 
 		 317 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  61.08 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  61.51 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  61.08 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  61.08 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  60.06 
 
 		 321 aa  384  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  58.99 
 
 		 317 aa  381  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  61.51 
 
 		 317 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  55.66 
 
 		 313 aa  376  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  56.63 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  56.59 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4584  malate dehydrogenase, NAD-dependent  60 
 
 		 320 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0641  malate dehydrogenase  55.99 
 
 		 313 aa  358  7e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  61.44 
 
 		 312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  55.05 
 
 		 308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  62.3 
 
 		 312 aa  354  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  51.43 
 
 		 318 aa  345  8e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  52.4 
 
 		 314 aa  345  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  61.66 
 
 		 312 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  61.66 
 
 		 312 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  52.24 
 
 		 312 aa  342  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  53.27 
 
 		 308 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  52.09 
 
 		 312 aa  338  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  51.77 
 
 		 309 aa  338  7e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  52.09 
 
 		 312 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  51.13 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  51.13 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  51.13 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  50.8 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  51.13 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  51.13 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  51.13 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  51.13 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  51.13 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  50.8 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  51.13 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  50.64 
 
 		 315 aa  332  7.000000000000001e-90  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  50 
 
 		 310 aa  321  9.000000000000001e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  49.34 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  49.17 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  49.37 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  50.48 
 
 		 309 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  47.92 
 
 		 310 aa  311  7.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.06 
 
 		 320 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.06 
 
 		 320 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  45.69 
 
 		 313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  47.25 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  49.83 
 
 		 312 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  47.68 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  44.88 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  49.17 
 
 		 310 aa  298  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  48.58 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  51.77 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  45.31 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.1 
 
 		 312 aa  279  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  44.05 
 
 		 312 aa  272  6e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0451  malate dehydrogenase  44.63 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>