More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1121 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  100 
 
 
309 aa  617  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  68.73 
 
 
308 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  61.94 
 
 
312 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  61.29 
 
 
312 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  59.55 
 
 
312 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  59.55 
 
 
312 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  59.55 
 
 
312 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  59.55 
 
 
312 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  59.55 
 
 
312 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  59.55 
 
 
312 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  59.55 
 
 
312 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  59.22 
 
 
312 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  60.2 
 
 
308 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  59.22 
 
 
312 aa  388  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  59.55 
 
 
312 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  59.55 
 
 
312 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  58.36 
 
 
309 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  56.21 
 
 
314 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  57.7 
 
 
309 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  56.91 
 
 
311 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  60.33 
 
 
309 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  56.82 
 
 
320 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  53.85 
 
 
316 aa  369  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  55.48 
 
 
321 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  56.33 
 
 
320 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  55.81 
 
 
322 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  55.7 
 
 
320 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  55.81 
 
 
321 aa  365  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  56.33 
 
 
320 aa  364  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  55.02 
 
 
320 aa  362  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  55.84 
 
 
320 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  54.43 
 
 
320 aa  362  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  54.43 
 
 
338 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  55.84 
 
 
320 aa  362  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  56.33 
 
 
320 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  55.81 
 
 
320 aa  361  7.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  54.05 
 
 
333 aa  361  9e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  55.52 
 
 
320 aa  360  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  56.96 
 
 
322 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  56.63 
 
 
322 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  56.33 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  57.14 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  57.14 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  58.39 
 
 
321 aa  355  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  54.69 
 
 
322 aa  355  6.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  55.16 
 
 
322 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0419  malate dehydrogenase  55.66 
 
 
322 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425489  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  53.07 
 
 
320 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  55.84 
 
 
320 aa  349  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  53.11 
 
 
307 aa  346  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  59.08 
 
 
311 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  54 
 
 
326 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  53.23 
 
 
320 aa  345  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  53.23 
 
 
320 aa  345  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  54.84 
 
 
320 aa  345  6e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  51.97 
 
 
310 aa  343  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  53.87 
 
 
320 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  52.22 
 
 
320 aa  342  2.9999999999999997e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0392  malate dehydrogenase  55.02 
 
 
322 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.208989 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2161  malate dehydrogenase, NAD-dependent  53.23 
 
 
320 aa  342  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  56.07 
 
 
312 aa  340  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  50.16 
 
 
310 aa  339  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  51.78 
 
 
313 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  56.31 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2501  malate dehydrogenase, NAD-dependent  54.19 
 
 
321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.448823 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  50.49 
 
 
310 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  53.2 
 
 
320 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  53.2 
 
 
320 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  50.32 
 
 
317 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  49.52 
 
 
318 aa  334  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  49.04 
 
 
313 aa  334  1e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  49.68 
 
 
321 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  50 
 
 
317 aa  334  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3604  malate dehydrogenase, NAD-dependent  53.23 
 
 
320 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  53.33 
 
 
324 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  51.13 
 
 
316 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  51.34 
 
 
310 aa  330  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  49.35 
 
 
317 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  49.84 
 
 
316 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  51.58 
 
 
320 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  49.84 
 
 
316 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  49.84 
 
 
316 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  50.97 
 
 
320 aa  329  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  50.16 
 
 
310 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  49.05 
 
 
317 aa  329  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  50.33 
 
 
320 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  50 
 
 
317 aa  322  7e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0641  malate dehydrogenase  47.44 
 
 
313 aa  320  3e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  54.25 
 
 
312 aa  318  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  53.59 
 
 
312 aa  318  9e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  51.34 
 
 
310 aa  317  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_393  malate dehydrogenase, NAD-dependent  50.16 
 
 
308 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.871516  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0451  malate dehydrogenase  50.16 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  51.32 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0428  malate dehydrogenase  49.51 
 
 
307 aa  311  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  50.66 
 
 
312 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  51.5 
 
 
312 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.54 
 
 
316 aa  305  6e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  50.16 
 
 
313 aa  305  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  45.9 
 
 
304 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>