More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1140 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1140  malate dehydrogenase, NAD-dependent  100 
 
 
307 aa  623  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208998  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  54.21 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  53.82 
 
 
326 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  52.15 
 
 
308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  53.14 
 
 
314 aa  325  7e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_393  malate dehydrogenase, NAD-dependent  51.15 
 
 
308 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.871516  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  50.99 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  49.35 
 
 
309 aa  318  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0428  malate dehydrogenase  50.82 
 
 
307 aa  318  7.999999999999999e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0451  malate dehydrogenase  51.15 
 
 
307 aa  318  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  50 
 
 
309 aa  316  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  50.17 
 
 
311 aa  311  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  50.33 
 
 
310 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  49.83 
 
 
320 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  49.83 
 
 
320 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  51.52 
 
 
310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  50.99 
 
 
312 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  50.33 
 
 
310 aa  308  6.999999999999999e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  45.25 
 
 
307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  49.67 
 
 
310 aa  306  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  51.82 
 
 
309 aa  306  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  49.34 
 
 
310 aa  302  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  48.84 
 
 
309 aa  297  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  49.67 
 
 
320 aa  295  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  47.49 
 
 
312 aa  295  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  47.49 
 
 
312 aa  295  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  47.49 
 
 
312 aa  295  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  47.49 
 
 
312 aa  295  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  47.49 
 
 
312 aa  295  6e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  47.49 
 
 
312 aa  295  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  47.49 
 
 
312 aa  295  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  47.49 
 
 
312 aa  295  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  47.49 
 
 
312 aa  295  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  47.16 
 
 
312 aa  295  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  47.49 
 
 
312 aa  295  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  47.49 
 
 
312 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  47.49 
 
 
312 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  49.02 
 
 
310 aa  293  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  43.83 
 
 
316 aa  289  3e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  46.53 
 
 
320 aa  287  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  46.23 
 
 
320 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  45.03 
 
 
321 aa  285  5e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.41 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  45.21 
 
 
333 aa  282  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  45.57 
 
 
320 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  46.05 
 
 
320 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  45.25 
 
 
320 aa  279  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  49.66 
 
 
310 aa  279  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0864  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.51 
 
 
312 aa  279  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  45.03 
 
 
321 aa  279  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5970  malate dehydrogenase, NAD-dependent  51.14 
 
 
310 aa  278  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284223  normal  0.475687 
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  45.25 
 
 
320 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.67 
 
 
313 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  45.39 
 
 
320 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  45.54 
 
 
320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  46.82 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.12 
 
 
320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  43.32 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  46.05 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.03 
 
 
320 aa  272  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  47.23 
 
 
318 aa  272  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.03 
 
 
320 aa  272  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  45.87 
 
 
320 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  46.67 
 
 
311 aa  271  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  45.72 
 
 
312 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.83 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  45.39 
 
 
320 aa  268  8.999999999999999e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  44.08 
 
 
338 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  44.08 
 
 
320 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  42.16 
 
 
317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  43.14 
 
 
317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  44.74 
 
 
320 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2501  malate dehydrogenase, NAD-dependent  45.7 
 
 
321 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.448823 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  45.07 
 
 
312 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  42.81 
 
 
316 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  42.38 
 
 
322 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  43.46 
 
 
317 aa  263  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  42.77 
 
 
316 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  42.77 
 
 
316 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  45.57 
 
 
320 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  45.57 
 
 
320 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  42.67 
 
 
317 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  42.44 
 
 
316 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  41.69 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  45.72 
 
 
312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  45.72 
 
 
312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.85 
 
 
320 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3604  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.71 
 
 
320 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08746  malate dehydrogenase  44 
 
 
308 aa  256  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  42.36 
 
 
318 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.52 
 
 
309 aa  255  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  44.52 
 
 
321 aa  255  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.09 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  43.93 
 
 
320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  44.34 
 
 
310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1675  malate dehydrogenase  39.8 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0291374  normal  0.817536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2161  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.71 
 
 
320 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  38.31 
 
 
313 aa  252  7e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  42.9 
 
 
320 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  42.72 
 
 
322 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>