More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1273 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  100 
 
 		 324 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  72.43 
 
 		 326 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  67.77 
 
 		 320 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  67.77 
 
 		 320 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  58.92 
 
 		 311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  56.71 
 
 		 308 aa  356  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  54.49 
 
 		 309 aa  345  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  53.16 
 
 		 309 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  56.95 
 
 		 312 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  53.33 
 
 		 309 aa  333  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  49.67 
 
 		 307 aa  332  5e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  52.32 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  52.13 
 
 		 308 aa  328  9e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  51.83 
 
 		 314 aa  326  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  50.33 
 
 		 310 aa  322  5e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  52 
 
 		 310 aa  322  6e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1140  malate dehydrogenase, NAD-dependent  50.99 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208998  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  52.13 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  50.33 
 
 		 310 aa  316  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  50.65 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  50.8 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_393  malate dehydrogenase, NAD-dependent  48.68 
 
 		 308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.871516  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0428  malate dehydrogenase  48.68 
 
 		 307 aa  311  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  49.35 
 
 		 316 aa  311  1e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  49.19 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  48.71 
 
 		 317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  48.86 
 
 		 317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0451  malate dehydrogenase  47.68 
 
 		 307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  50.82 
 
 		 312 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  50.33 
 
 		 312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  52.67 
 
 		 310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  49.17 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  51.31 
 
 		 310 aa  305  8.000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  47.74 
 
 		 317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  49.01 
 
 		 312 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5970  malate dehydrogenase, NAD-dependent  51.34 
 
 		 310 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284223  normal  0.475687 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  50.17 
 
 		 312 aa  301  9e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  49.67 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  47.06 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  47.1 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  46.82 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  50.84 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  50.84 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  50.84 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  50.84 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  50.84 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  50.84 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  50.84 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  50.84 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  50.84 
 
 		 312 aa  298  9e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  46.03 
 
 		 320 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  50.5 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  46.33 
 
 		 321 aa  295  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  45.7 
 
 		 333 aa  295  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  45.86 
 
 		 320 aa  293  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  48.67 
 
 		 309 aa  292  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  47.71 
 
 		 322 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  48.33 
 
 		 312 aa  291  7e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  46.03 
 
 		 321 aa  291  9e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  48 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  46.51 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  47.19 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  51.99 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  47.68 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  46.41 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  45.54 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  46.23 
 
 		 313 aa  289  4e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  46.41 
 
 		 322 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  46.89 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  46.89 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  46.18 
 
 		 320 aa  288  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  46.18 
 
 		 320 aa  288  9e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  46.62 
 
 		 318 aa  288  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.35 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  49.34 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  49.34 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  46.56 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  45.85 
 
 		 320 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  45.08 
 
 		 320 aa  286  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  48.33 
 
 		 312 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0641  malate dehydrogenase  45.75 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  43.93 
 
 		 338 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  44.13 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  45.75 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47 
 
 		 313 aa  282  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.79 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.79 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  45.1 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  45.25 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  45.67 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2377  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.58 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.379215  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  48.37 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0419  malate dehydrogenase  46.03 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3604  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.06 
 
 		 320 aa  278  7e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  44.44 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2971  malate dehydrogenase, NAD-dependent  49.51 
 
 		 307 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  44.88 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0392  malate dehydrogenase  46.03 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.208989 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2501  malate dehydrogenase, NAD-dependent  48.04 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.448823 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.98 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>