More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5970 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5970  malate dehydrogenase, NAD-dependent  100 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284223  normal  0.475687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4414  malate dehydrogenase, NAD-dependent  79.03 
 
 		 317 aa  458  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0615  Lactate/malate dehydrogenase  76.9 
 
 		 316 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4174  lactate/malate dehydrogenase  76.58 
 
 		 316 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714924  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3794  lactate/malate dehydrogenase  76.27 
 
 		 316 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0387  malate dehydrogenase (NAD)  70.75 
 
 		 330 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  53.16 
 
 		 311 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  49.68 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  50.5 
 
 		 314 aa  325  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  49.03 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  51.68 
 
 		 326 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  48.86 
 
 		 310 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  51.5 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  51.34 
 
 		 324 aa  318  7.999999999999999e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  52.9 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  48.21 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  48.99 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  47.56 
 
 		 310 aa  311  6.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  50.67 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  50.67 
 
 		 308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  50.99 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.99 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.99 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  48.33 
 
 		 312 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  48.33 
 
 		 312 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  48.33 
 
 		 312 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  48.33 
 
 		 312 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  46.25 
 
 		 310 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  48.33 
 
 		 312 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  48.33 
 
 		 312 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  48.33 
 
 		 312 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  48.33 
 
 		 312 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  48.33 
 
 		 312 aa  300  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  47.67 
 
 		 312 aa  299  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0428  malate dehydrogenase  50 
 
 		 307 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  48.33 
 
 		 312 aa  299  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1140  malate dehydrogenase, NAD-dependent  51.14 
 
 		 307 aa  299  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208998  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  47.88 
 
 		 310 aa  298  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  48 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  48.51 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0451  malate dehydrogenase  49.84 
 
 		 307 aa  295  6e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_393  malate dehydrogenase, NAD-dependent  49.51 
 
 		 308 aa  295  7e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.871516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  47.33 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  48.18 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.7 
 
 		 333 aa  292  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  47.73 
 
 		 317 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  47.88 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  47.23 
 
 		 317 aa  288  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  47.52 
 
 		 320 aa  288  9e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  47.08 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  46.58 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  46.36 
 
 		 320 aa  285  9e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  46.98 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  51.17 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  47.71 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  47.39 
 
 		 321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  45.87 
 
 		 320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  47.52 
 
 		 320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  45.87 
 
 		 321 aa  281  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  46.73 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  46.1 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  45.7 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  46.41 
 
 		 316 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  46.41 
 
 		 316 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  45.7 
 
 		 320 aa  278  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  46.86 
 
 		 320 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  45.36 
 
 		 320 aa  277  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  50.5 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  43.89 
 
 		 321 aa  276  4e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  42.24 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  46.53 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  45.93 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  45.54 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  45.54 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  48.18 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  49.67 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  45.54 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  45.54 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  42.95 
 
 		 313 aa  267  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  46.53 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  46.23 
 
 		 312 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  45.87 
 
 		 322 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  43.97 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  45.54 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  42.9 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  42.57 
 
 		 320 aa  263  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0419  malate dehydrogenase  45.54 
 
 		 322 aa  262  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  45.21 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.89 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2341  Lactate/malate dehydrogenase  48.12 
 
 		 390 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141396  hitchhiker  0.00418308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.75 
 
 		 309 aa  259  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  45.03 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  45.03 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  44.7 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.01 
 
 		 313 aa  255  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  43.04 
 
 		 311 aa  255  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  44.33 
 
 		 310 aa  255  7e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.66 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  39.81 
 
 		 313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>