More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_06717 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06717  malate dehydrogenase (Eurofung)  100 
 
 
340 aa  681    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66451  mitochondrial malate dehydrogenase  67.88 
 
 
332 aa  451  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390905  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03490  malate dehydrogenase, putative  67.79 
 
 
338 aa  441  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06499  malate dehydrogenase, NAD-dependent (AFU_orthologue; AFUA_6G05210)  60.74 
 
 
330 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0415235 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03100  L-malate dehydrogenase, putative  59.09 
 
 
336 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.116944  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12282  predicted protein  55.9 
 
 
319 aa  334  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24671  predicted protein  55.38 
 
 
335 aa  333  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.880693  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51297  predicted protein  53.52 
 
 
345 aa  332  7.000000000000001e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40132  NAD-dependent malate dehydrogenase  53.15 
 
 
337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.019207 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78343  malate dehydrogenase  51.91 
 
 
346 aa  305  6e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.25351  decreased coverage  0.000277635 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05031  conserved hypothetical protein: similar to cytplasmic malate dehydrogenase (Eurofung)  49.38 
 
 
323 aa  305  7e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.702277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3622  malate dehydrogenase  53.18 
 
 
312 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.817971  normal  0.609182 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3550  malate dehydrogenase  53.18 
 
 
312 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3657  malate dehydrogenase  53.18 
 
 
312 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3551  malate dehydrogenase  53.18 
 
 
312 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3719  malate dehydrogenase  52.87 
 
 
312 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.321061 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0470  malate dehydrogenase  52.55 
 
 
312 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.127263 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03096  malate dehydrogenase  52.55 
 
 
312 aa  295  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0470  malate dehydrogenase, NAD-dependent  52.55 
 
 
312 aa  295  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4553  malate dehydrogenase  52.55 
 
 
312 aa  295  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0724333  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3425  malate dehydrogenase  52.55 
 
 
312 aa  295  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.672879  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03047  hypothetical protein  52.55 
 
 
312 aa  295  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3540  malate dehydrogenase  52.55 
 
 
312 aa  295  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3719  malate dehydrogenase  52.55 
 
 
312 aa  295  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0322257  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3532  malate dehydrogenase  52.23 
 
 
312 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.45791  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0359  malate dehydrogenase  52.52 
 
 
311 aa  293  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000905728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2850  malate dehydrogenase  49.85 
 
 
353 aa  293  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.371941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3671  malate dehydrogenase  51.91 
 
 
312 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.306817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0672  malate dehydrogenase  53.46 
 
 
311 aa  292  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001676  malate dehydrogenase  51.26 
 
 
311 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000765273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0539  malate dehydrogenase  53.18 
 
 
311 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32875  predicted protein  51.57 
 
 
370 aa  290  3e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00795  malate dehydrogenase  50.63 
 
 
311 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0469  malate dehydrogenase  51.91 
 
 
312 aa  289  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000123185  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0553  malate dehydrogenase  52.38 
 
 
312 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0788  malate dehydrogenase  52.06 
 
 
311 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000050316  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0850  malate dehydrogenase  52.52 
 
 
311 aa  288  9e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0952  malate dehydrogenase  51.89 
 
 
311 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0373108  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4514  malate dehydrogenase  53.18 
 
 
311 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0867  malate dehydrogenase  52.52 
 
 
311 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000793131  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3484  malate dehydrogenase  51.27 
 
 
313 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000124556  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3173  malate dehydrogenase  50.94 
 
 
311 aa  285  9e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0439183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3509  malate dehydrogenase  51.57 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0303223  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3219  malate dehydrogenase  51.57 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3761  malate dehydrogenase  51.27 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.420142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3971  malate dehydrogenase  51.27 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3339  malate dehydrogenase  51.57 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0614  malate dehydrogenase  51.57 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3616  malate dehydrogenase  51.27 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606227  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0770  malate dehydrogenase  51.57 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3365  malate dehydrogenase  51.91 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000174685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3627  malate dehydrogenase  51.26 
 
 
311 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.454276  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1002  malate dehydrogenase  51.43 
 
 
311 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000312167  hitchhiker  0.0000277575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00736  malate dehydrogenase  52.23 
 
 
312 aa  282  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0609  malate dehydrogenase  51.26 
 
 
311 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3685  malate dehydrogenase  51.26 
 
 
311 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184642  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3809  malate dehydrogenase  50.94 
 
 
311 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488572  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0826  malate dehydrogenase  50.63 
 
 
311 aa  279  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1055  malate dehydrogenase  53 
 
 
311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000618832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0297  malate dehydrogenase  48.09 
 
 
319 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  33.56 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.85 
 
 
312 aa  106  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  31.03 
 
 
332 aa  102  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  30.09 
 
 
312 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  31.19 
 
 
317 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.43 
 
 
333 aa  99.8  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2377  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.74 
 
 
307 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.379215  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.31 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.91 
 
 
315 aa  99  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  32.67 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  30.57 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0864  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.64 
 
 
312 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343298 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  30.09 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  30.41 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  30.41 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  30.67 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  31.79 
 
 
322 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.16 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  28.57 
 
 
316 aa  96.3  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  30.37 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  30.37 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  30.61 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2971  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.16 
 
 
307 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.02 
 
 
311 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  29.43 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.12 
 
 
320 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.12 
 
 
320 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.86 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  32.48 
 
 
312 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  31.99 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  31.17 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.86 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  29.88 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  29.03 
 
 
312 aa  93.2  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  30 
 
 
320 aa  93.2  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  29.94 
 
 
317 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1271  malate dehydrogenase  30.64 
 
 
319 aa  93.2  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.845217  normal  0.680295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  33.5 
 
 
311 aa  92.8  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.77 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  31.08 
 
 
322 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>