More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66451 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_66451  mitochondrial malate dehydrogenase  100 
 
 		 332 aa  662    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390905  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06717  malate dehydrogenase (Eurofung)  69.3 
 
 		 340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03490  malate dehydrogenase, putative  65.94 
 
 		 338 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24671  predicted protein  55.29 
 
 		 335 aa  335  7e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.880693  normal  0.0269583 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06499  malate dehydrogenase, NAD-dependent (AFU_orthologue; AFUA_6G05210)  55.21 
 
 		 330 aa  329  4e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0415235 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12282  predicted protein  56.83 
 
 		 319 aa  324  1e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40132  NAD-dependent malate dehydrogenase  52.41 
 
 		 337 aa  324  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.019207 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51297  predicted protein  54.08 
 
 		 345 aa  323  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03100  L-malate dehydrogenase, putative  54.33 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.116944  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0539  malate dehydrogenase  53.21 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78343  malate dehydrogenase  50.88 
 
 		 346 aa  295  6e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.25351  decreased coverage  0.000277635 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0359  malate dehydrogenase  51.76 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000905728  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00795  malate dehydrogenase  52.08 
 
 		 311 aa  291  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001676  malate dehydrogenase  51.44 
 
 		 311 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000765273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3219  malate dehydrogenase  51.12 
 
 		 311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0770  malate dehydrogenase  51.12 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2850  malate dehydrogenase  49.7 
 
 		 353 aa  288  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.371941  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3339  malate dehydrogenase  51.12 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0614  malate dehydrogenase  51.12 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3173  malate dehydrogenase  51.12 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0439183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0952  malate dehydrogenase  51.44 
 
 		 311 aa  288  9e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0373108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3509  malate dehydrogenase  51.12 
 
 		 311 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0303223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3685  malate dehydrogenase  50.8 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184642  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0609  malate dehydrogenase  50.8 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00736  malate dehydrogenase  52.56 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3627  malate dehydrogenase  50.8 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.454276  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05031  conserved hypothetical protein: similar to cytplasmic malate dehydrogenase (Eurofung)  48.76 
 
 		 323 aa  286  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.702277 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0826  malate dehydrogenase  50.8 
 
 		 311 aa  286  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1002  malate dehydrogenase  51.44 
 
 		 311 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000312167  hitchhiker  0.0000277575 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3809  malate dehydrogenase  50.48 
 
 		 311 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0867  malate dehydrogenase  51.12 
 
 		 311 aa  285  9e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000793131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0672  malate dehydrogenase  52.08 
 
 		 311 aa  285  9e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32875  predicted protein  53.97 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0850  malate dehydrogenase  51.12 
 
 		 311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4514  malate dehydrogenase  50.96 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3365  malate dehydrogenase  49.04 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000174685  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3671  malate dehydrogenase  49.04 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.306817 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3971  malate dehydrogenase  48.09 
 
 		 312 aa  275  8e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3761  malate dehydrogenase  48.09 
 
 		 312 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.420142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3616  malate dehydrogenase  48.09 
 
 		 312 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606227  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0788  malate dehydrogenase  48.24 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000050316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0553  malate dehydrogenase  48.56 
 
 		 312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0470  malate dehydrogenase  48.09 
 
 		 312 aa  273  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3622  malate dehydrogenase  48.25 
 
 		 312 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.817971  normal  0.609182 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03096  malate dehydrogenase  48.09 
 
 		 312 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0470  malate dehydrogenase, NAD-dependent  48.09 
 
 		 312 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4553  malate dehydrogenase  48.09 
 
 		 312 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0724333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3425  malate dehydrogenase  48.09 
 
 		 312 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.672879  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3719  malate dehydrogenase  48.09 
 
 		 312 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0322257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03047  hypothetical protein  48.09 
 
 		 312 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3540  malate dehydrogenase  48.09 
 
 		 312 aa  272  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3657  malate dehydrogenase  48.25 
 
 		 312 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3551  malate dehydrogenase  48.25 
 
 		 312 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3550  malate dehydrogenase  48.25 
 
 		 312 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3532  malate dehydrogenase  48.09 
 
 		 312 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.45791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3719  malate dehydrogenase  47.94 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321061 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1055  malate dehydrogenase  50.96 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000618832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3484  malate dehydrogenase  46.67 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000124556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0469  malate dehydrogenase  48.24 
 
 		 312 aa  265  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000123185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0297  malate dehydrogenase  49.52 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  33.12 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  29.77 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  31.23 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  31.91 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  32.17 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  31.41 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  31.55 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  31.55 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  28.44 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.05 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2971  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.14 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  32.91 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  32.17 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  34.22 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  32.56 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.46 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4174  lactate/malate dehydrogenase  34.62 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714924  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.13 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  31.99 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  31.52 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.74 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0697  malate dehydrogenase  30.97 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  27.81 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.44 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  32.6 
 
 		 321 aa  93.2  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.44 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  30.08 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  31.01 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  29.15 
 
 		 312 aa  92.4  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2377  malate dehydrogenase, NAD-dependent  28.82 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.379215  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  30.03 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.62 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.62 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0615  Lactate/malate dehydrogenase  32.69 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  31.76 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  33.33 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2501  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.77 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.448823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  29.5 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  33.77 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.26 
 
 		 311 aa  90.1  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>