More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2444 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2444  malate dehydrogenase  100 
 
 		 317 aa  643    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0492  malate dehydrogenase  68.25 
 
 		 332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2590  malate dehydrogenase  67.09 
 
 		 318 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.662548  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2343  malate dehydrogenase  64.44 
 
 		 317 aa  426  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1271  malate dehydrogenase  57.01 
 
 		 319 aa  379  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.845217  normal  0.680295 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1548  malate dehydrogenase  42.26 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0959  malate dehydrogenase  42.62 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0610  malate dehydrogenase  42.36 
 
 		 313 aa  242  5e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1669  malate dehydrogenase  41.31 
 
 		 314 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0936564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0244  malate dehydrogenase  41.31 
 
 		 314 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  38.02 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  37.3 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  37.18 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  37.18 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  39.04 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  37.18 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  37.18 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  37.18 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  37.18 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  37.18 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  37.18 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  37.18 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  36.54 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  38.03 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  39.92 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  41.18 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  40.82 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  34.34 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  35.24 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  34.94 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.67 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  40 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  37.37 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  37.01 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  35.26 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  35.54 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  35.6 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  32.28 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  36.24 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  37.7 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  36.24 
 
 		 317 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  36.31 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  32.58 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1299  lactate/malate dehydrogenase  33.23 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  33.33 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23050  malate dehydrogenase (NAD)  38.84 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697126  normal  0.046368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  34.82 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  32.69 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  32.68 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  30.57 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  32.27 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1564  L-lactate dehydrogenase  38.75 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  hitchhiker  0.00299399 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  38 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  32.78 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  34.53 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  40.5 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  31.73 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  33.22 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  39.09 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  31.8 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 401 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  33.76 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  34.84 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2434  L-lactate dehydrogenase  38.59 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167349  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1746  Lactate/malate dehydrogenase  35.6 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.591048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 316 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  30.69 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  32.6 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1116  L-lactate dehydrogenase  38.06 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0119464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  34.08 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  36.4 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  30.91 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.97 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  31.85 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  31.7 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  38.04 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  35.34 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  31.7 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  31.7 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  31.7 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  34.55 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>