More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2156 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
316 aa  637    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  83.28 
 
 
319 aa  519  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  83.28 
 
 
319 aa  519  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  58.44 
 
 
317 aa  363  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  58.44 
 
 
317 aa  363  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  55.48 
 
 
315 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  56.77 
 
 
314 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  56.77 
 
 
314 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  56.77 
 
 
314 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  56.77 
 
 
314 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  56.77 
 
 
314 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  56.77 
 
 
314 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  56.77 
 
 
314 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  53.31 
 
 
319 aa  354  7.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  56.77 
 
 
314 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  55.81 
 
 
314 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  55.02 
 
 
314 aa  354  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  55.81 
 
 
314 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  55.81 
 
 
314 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  55.81 
 
 
314 aa  354  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  55.81 
 
 
314 aa  354  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  55.81 
 
 
314 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  55.81 
 
 
314 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  56.45 
 
 
314 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  55.81 
 
 
314 aa  353  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  56.13 
 
 
314 aa  351  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  54.93 
 
 
317 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  54.07 
 
 
319 aa  342  4e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  55.81 
 
 
314 aa  342  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  55.16 
 
 
314 aa  341  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  55.63 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  56.31 
 
 
329 aa  335  5e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  52.29 
 
 
325 aa  324  1e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  49.18 
 
 
311 aa  308  9e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  49.17 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  48.25 
 
 
314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  48.25 
 
 
314 aa  301  1e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  49.02 
 
 
323 aa  300  3e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  48.53 
 
 
317 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  48.42 
 
 
317 aa  296  3e-79  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  46.69 
 
 
316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  48.01 
 
 
311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  46.77 
 
 
331 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  44.04 
 
 
321 aa  278  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  44.3 
 
 
317 aa  276  3e-73  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  45.36 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  46.05 
 
 
317 aa  271  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  46.05 
 
 
317 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  41.29 
 
 
316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1232  L-lactate dehydrogenase  44.55 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00828905  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  42.86 
 
 
318 aa  265  8.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  43.91 
 
 
310 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  43.93 
 
 
320 aa  263  2e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  41.72 
 
 
316 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  41.72 
 
 
401 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  41.72 
 
 
316 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  41.72 
 
 
316 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  41.72 
 
 
316 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  43.18 
 
 
325 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  41.72 
 
 
316 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  44.56 
 
 
322 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  41.4 
 
 
316 aa  262  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  41.4 
 
 
316 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  43.37 
 
 
318 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  41.81 
 
 
312 aa  259  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  44.55 
 
 
314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  41.14 
 
 
316 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  40.19 
 
 
316 aa  258  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  42.04 
 
 
312 aa  256  5e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  43.23 
 
 
335 aa  255  6e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  42.62 
 
 
320 aa  255  6e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  42.95 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  40.51 
 
 
316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  42.17 
 
 
319 aa  251  8.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2352  L-lactate dehydrogenase  43.19 
 
 
309 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0365594  normal  0.0145977 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  43.65 
 
 
317 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  39.8 
 
 
309 aa  250  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  41.07 
 
 
318 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1522  L-lactate dehydrogenase  41.75 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0323488  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  40.72 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  40.65 
 
 
320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3978  malate dehydrogenase (NAD)  40.58 
 
 
315 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  40.76 
 
 
309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  40.58 
 
 
307 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1116  L-lactate dehydrogenase  40 
 
 
317 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0119464  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  40.45 
 
 
308 aa  236  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  38.44 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  40.88 
 
 
323 aa  232  5e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  41.04 
 
 
319 aa  232  6e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  39.16 
 
 
313 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1203  L-lactate dehydrogenase  41.53 
 
 
313 aa  225  7e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2434  L-lactate dehydrogenase  37.25 
 
 
325 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167349  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  39.61 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21510  Putative membrane-bound L-lactate-quinone oxidoreductase  36.03 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  36.69 
 
 
316 aa  218  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  34.92 
 
 
341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23050  malate dehydrogenase (NAD)  37.2 
 
 
331 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697126  normal  0.046368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1564  L-lactate dehydrogenase  36.36 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  hitchhiker  0.00299399 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  36.54 
 
 
310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  39.23 
 
 
318 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>