More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0959 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0959  malate dehydrogenase  100 
 
 		 314 aa  632  1e-180  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0244  malate dehydrogenase  93.95 
 
 		 314 aa  600  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1669  malate dehydrogenase  94.27 
 
 		 314 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0936564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1548  malate dehydrogenase  75.16 
 
 		 314 aa  499  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0610  malate dehydrogenase  62.42 
 
 		 313 aa  410  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2343  malate dehydrogenase  45.08 
 
 		 317 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0492  malate dehydrogenase  45.34 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2590  malate dehydrogenase  42.62 
 
 		 318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.662548  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2444  malate dehydrogenase  42.62 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1271  malate dehydrogenase  38.24 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.845217  normal  0.680295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  37.22 
 
 		 310 aa  188  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  35.65 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  35.96 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  37.66 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  35.65 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  37.79 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  36.71 
 
 		 312 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  34.38 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  37.22 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  36.33 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  36.33 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  36.33 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  36.33 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  36.33 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  36.33 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  36.33 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  36.33 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  36.33 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  36.01 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  34.97 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  36.62 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  35.35 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  34.56 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  34.85 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  38.35 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  35.5 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  36.91 
 
 		 311 aa  162  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.81 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  34.49 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1299  lactate/malate dehydrogenase  32.01 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  34.49 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  36.93 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  36.93 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.47 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  30.87 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  34.06 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  34.38 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  33.02 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  33.02 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  30.39 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  30.62 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  30.84 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  32.5 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  33.64 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.31 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  33.44 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  33.44 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  31.07 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  33.97 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  34.38 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  33.75 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  29.08 
 
 		 314 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  29.08 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  29.08 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  29.08 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  29.08 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  29.08 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.05 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  29.08 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  29.08 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  30.07 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  29.08 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  31.55 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1746  Lactate/malate dehydrogenase  31.49 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.591048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.37 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  29.08 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  32.36 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.87 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  30.6 
 
 		 310 aa  143  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.68 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  32.61 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  32.3 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  32.17 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  32.3 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2377  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.7 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.379215  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  35.53 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  33.23 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  32.71 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  31.95 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.37 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  30.28 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>