More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1746 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1746  Lactate/malate dehydrogenase  100 
 
 		 317 aa  630  1e-180  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.591048  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1299  lactate/malate dehydrogenase  62.42 
 
 		 309 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  39.61 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  40.33 
 
 		 314 aa  238  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  38.39 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  37.99 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  39.09 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  38.71 
 
 		 319 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  41.56 
 
 		 310 aa  231  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  36.86 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  38.16 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  37.97 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  38.16 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  36.77 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  39.17 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  36.72 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  39.62 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  36.13 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  37.42 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  37.3 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  38.56 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  37.04 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  36.19 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  37.82 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  36.33 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  38.89 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  39.32 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  37.5 
 
 		 320 aa  209  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  37.62 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  36.48 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  34.41 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  39.1 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 		 314 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  34.3 
 
 		 315 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  36.48 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  35.57 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  35.28 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  35.28 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 314 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  37.58 
 
 		 310 aa  202  9e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  37.37 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1203  L-lactate dehydrogenase  37.46 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1522  L-lactate dehydrogenase  37.28 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0323488  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  33.22 
 
 		 323 aa  198  7.999999999999999e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23050  malate dehydrogenase (NAD)  36.12 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697126  normal  0.046368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  35.35 
 
 		 316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  35.26 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  35.02 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  34.7 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1564  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  hitchhiker  0.00299399 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  34.18 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  33.86 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  35.93 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  33.86 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  34.18 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  34.18 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  34.7 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  33.86 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  33.86 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  33.86 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21510  Putative membrane-bound L-lactate-quinone oxidoreductase  37.37 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1116  L-lactate dehydrogenase  36.33 
 
 		 317 aa  192  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0119464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  37.86 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  33.97 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  34.42 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  34.52 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  34.31 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  32.25 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  33.97 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  36.09 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  35.5 
 
 		 312 aa  185  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2434  L-lactate dehydrogenase  36.33 
 
 		 325 aa  185  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167349  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0370  malate dehydrogenase (NAD)  36.81 
 
 		 329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0237216  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  34.41 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  36.62 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0697  malate dehydrogenase  37.34 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0382  malate dehydrogenase (NAD)  36.81 
 
 		 329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277292  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3978  malate dehydrogenase (NAD)  34.19 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0391  malate dehydrogenase (NAD)  36.81 
 
 		 329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>