More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0439 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  100 
 
 
317 aa  653    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  62.86 
 
 
317 aa  419  1e-116  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  47.3 
 
 
314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  48.09 
 
 
314 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  48.09 
 
 
314 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  48.09 
 
 
314 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  48.09 
 
 
314 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  48.09 
 
 
314 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  48.09 
 
 
314 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  48.09 
 
 
314 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  49.52 
 
 
314 aa  298  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  49.52 
 
 
314 aa  298  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  49.52 
 
 
314 aa  298  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  49.52 
 
 
314 aa  298  6e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  49.52 
 
 
314 aa  298  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  49.52 
 
 
314 aa  298  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  49.52 
 
 
314 aa  298  6e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  47.77 
 
 
314 aa  298  8e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  49.21 
 
 
314 aa  297  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  49.21 
 
 
314 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  48.42 
 
 
316 aa  296  3e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  48.57 
 
 
314 aa  295  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  48.89 
 
 
315 aa  295  8e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  47.27 
 
 
319 aa  294  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  47.15 
 
 
314 aa  292  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  46.91 
 
 
324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  48.09 
 
 
314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  47.45 
 
 
314 aa  279  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  48.23 
 
 
311 aa  278  6e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  47.17 
 
 
319 aa  278  9e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  47.17 
 
 
319 aa  278  9e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  44.79 
 
 
317 aa  271  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  44.79 
 
 
317 aa  271  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  42.67 
 
 
323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  43.13 
 
 
316 aa  268  8.999999999999999e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  43.71 
 
 
319 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  46.84 
 
 
328 aa  265  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  45.36 
 
 
317 aa  262  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  41.88 
 
 
401 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  42.27 
 
 
316 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  41.88 
 
 
316 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  41.88 
 
 
316 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  41.56 
 
 
316 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  41.56 
 
 
316 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  41.56 
 
 
316 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  41.25 
 
 
316 aa  257  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  41.25 
 
 
316 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  41.64 
 
 
316 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  41.01 
 
 
316 aa  255  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  45.03 
 
 
329 aa  252  6e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1232  L-lactate dehydrogenase  43.23 
 
 
315 aa  249  4e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00828905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  41.85 
 
 
325 aa  249  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  41.94 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  41.94 
 
 
312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  42.77 
 
 
314 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 
318 aa  237  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  39.87 
 
 
322 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1232  L-lactate dehydrogenase  41.23 
 
 
319 aa  235  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  40.94 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  41.88 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf109  L-lactate dehydrogenase  40.51 
 
 
320 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0268317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  41.19 
 
 
307 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  38.98 
 
 
315 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  38.71 
 
 
316 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  40.39 
 
 
311 aa  229  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2352  L-lactate dehydrogenase  40.92 
 
 
309 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0365594  normal  0.0145977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  39.5 
 
 
318 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  41.53 
 
 
310 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  39.47 
 
 
314 aa  225  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  37.42 
 
 
325 aa  225  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  39.3 
 
 
317 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  38.76 
 
 
308 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  40.32 
 
 
309 aa  223  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  38.96 
 
 
335 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  36.69 
 
 
317 aa  222  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  38.26 
 
 
341 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  38.69 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  36.69 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  37.7 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  42.21 
 
 
319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  39.73 
 
 
322 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  37.74 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  38.19 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  38.17 
 
 
331 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  37.66 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  37.58 
 
 
318 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  37.54 
 
 
318 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  40.91 
 
 
320 aa  210  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  38.13 
 
 
319 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  38.89 
 
 
320 aa  207  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  36.16 
 
 
323 aa  206  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1203  L-lactate dehydrogenase  39.81 
 
 
313 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  36.42 
 
 
313 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  40 
 
 
310 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  36.39 
 
 
320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  36.39 
 
 
320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  34.63 
 
 
332 aa  199  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  36.39 
 
 
320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3978  malate dehydrogenase (NAD)  36.22 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  33.77 
 
 
316 aa  192  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>