299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1239 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 323 aa  661    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  42.59 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  42.59 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  42.59 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  42.59 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  42.59 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  42.59 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  42.59 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  42.9 
 
 		 314 aa  281  9e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  42.27 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  42.99 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  42.99 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  42.99 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  42.99 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  42.99 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  42.99 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  42.99 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  41.32 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  42.99 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  41.96 
 
 		 314 aa  275  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  41.82 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  41.88 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  42.9 
 
 		 314 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  40.85 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  42.9 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  41.88 
 
 		 325 aa  260  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  41.42 
 
 		 319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  42.04 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  42.04 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  40.75 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  41.07 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  40.19 
 
 		 401 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  40.5 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  40.19 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  40.19 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  40.19 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  40.19 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  40.19 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  40.5 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  39.87 
 
 		 324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  40.06 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  40.88 
 
 		 316 aa  249  6e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  38.15 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  42.07 
 
 		 328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  39.42 
 
 		 319 aa  245  8e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  37.54 
 
 		 311 aa  245  8e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  39.94 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  41.03 
 
 		 329 aa  239  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  38.87 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  38.87 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  39.12 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  39.68 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  37.46 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1232  L-lactate dehydrogenase  38.44 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  36.98 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  36.16 
 
 		 317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  36.79 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  36.76 
 
 		 316 aa  219  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1232  L-lactate dehydrogenase  40.19 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00828905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  37.11 
 
 		 314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  35.48 
 
 		 316 aa  215  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  35.13 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  37.91 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  35.42 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  37.81 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  35.71 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  35.39 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  35.76 
 
 		 322 aa  205  7e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  34.89 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0194  malate dehydrogenase (NAD)  36.39 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000257978  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 319 aa  202  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  33.02 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  34.5 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  35.11 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  34.54 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  35.24 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  36.81 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  33.12 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0128  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  34.94 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000555723  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  34.7 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1552  malate dehydrogenase (NAD)  34.8 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  34.41 
 
 		 319 aa  192  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  32.81 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1325  malate dehydrogenase (NAD)  35.46 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000416686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  32.81 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0663  lactate/malate dehydrogenase, NAD binding domain protein  35.53 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  33.97 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  32.9 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  34.44 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1540  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  32.59 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1522  L-lactate dehydrogenase  32.31 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0323488  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1903  malate dehydrogenase (NAD)  33.54 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  32.48 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3978  malate dehydrogenase (NAD)  31.13 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1116  L-lactate dehydrogenase  31.23 
 
 		 317 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0119464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  30.41 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  31.1 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>