More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1232 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1232  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 319 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  66.14 
 
 		 322 aa  433  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  41.18 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  41.18 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  40.78 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  40.78 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  40.78 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  40.78 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  40.78 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  40.45 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  40.78 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  40.45 
 
 		 316 aa  269  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  40.78 
 
 		 316 aa  268  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  39.22 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  38.59 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  43 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  38.69 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  39.68 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  38.59 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  38.59 
 
 		 314 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  41.23 
 
 		 317 aa  235  6e-61  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  38.26 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  36.33 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0194  malate dehydrogenase (NAD)  41.85 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000257978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  38.91 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  36.36 
 
 		 317 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  36.36 
 
 		 317 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  37.25 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  39.03 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  38.26 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  36.81 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  35.67 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  35.78 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  39.41 
 
 		 314 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  39.74 
 
 		 314 aa  215  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  34.85 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  37.79 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  35.37 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  32.46 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  38.01 
 
 		 310 aa  209  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1552  malate dehydrogenase (NAD)  36.42 
 
 		 314 aa  208  8e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1903  malate dehydrogenase (NAD)  36.94 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  36.31 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  36.07 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1232  L-lactate dehydrogenase  38.1 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00828905  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1325  malate dehydrogenase (NAD)  36.25 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000416686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 		 317 aa  205  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  33.44 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  35.95 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  35.18 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  35.92 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  35.92 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  33.79 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  34.87 
 
 		 319 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  31.27 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0510  malate dehydrogenase (NAD)  37.3 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  31.27 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  34.17 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  34.3 
 
 		 307 aa  195  9e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0128  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  32.8 
 
 		 305 aa  195  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000555723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  32.9 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  34.11 
 
 		 335 aa  192  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  34.94 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0553  malate dehydrogenase (NAD)  35.53 
 
 		 304 aa  190  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.270119  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  34.3 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0663  lactate/malate dehydrogenase, NAD binding domain protein  36.01 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1540  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  35.62 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1203  L-lactate dehydrogenase  34.42 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  34.63 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  30.07 
 
 		 316 aa  185  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  31.37 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  33.77 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  29.9 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  31.48 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf109  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0268317  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  31.92 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0054  Lactate/malate dehydrogenase  36.74 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  31.19 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  29.74 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2352  L-lactate dehydrogenase  30.62 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0365594  normal  0.0145977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  35.69 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1182  L-lactate dehydrogenase  32.04 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>