More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1505 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
322 aa  661    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1232  L-lactate dehydrogenase  66.14 
 
 
319 aa  433  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 
316 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  46.56 
 
 
318 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  42.76 
 
 
401 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  42.76 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  42.76 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  42.76 
 
 
316 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  42.76 
 
 
316 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  42.76 
 
 
316 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  42.43 
 
 
316 aa  285  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  42.43 
 
 
316 aa  285  7e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  42.11 
 
 
316 aa  281  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  41.78 
 
 
316 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  39.68 
 
 
325 aa  270  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  39.48 
 
 
314 aa  258  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  40.72 
 
 
317 aa  242  7e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  34.41 
 
 
316 aa  239  6.999999999999999e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  39.87 
 
 
317 aa  237  2e-61  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  37.91 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  36.3 
 
 
314 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  36.3 
 
 
314 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  36.3 
 
 
314 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  36.3 
 
 
314 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  36.3 
 
 
314 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  36.84 
 
 
315 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  35.97 
 
 
314 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  36.3 
 
 
314 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  36.3 
 
 
314 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  35.97 
 
 
314 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  35.64 
 
 
314 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  36.96 
 
 
314 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  36.96 
 
 
314 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  36.96 
 
 
314 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  36.96 
 
 
314 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  36.96 
 
 
314 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  36.96 
 
 
314 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  36.96 
 
 
314 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  36.69 
 
 
317 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  36.69 
 
 
317 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  36.63 
 
 
314 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  37.34 
 
 
341 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  34.11 
 
 
319 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0194  malate dehydrogenase (NAD)  39.42 
 
 
310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000257978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  36.07 
 
 
311 aa  222  9e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  34.44 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  35.88 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  34.55 
 
 
317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  33.88 
 
 
319 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  34.43 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  37.29 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  36.96 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  33.65 
 
 
323 aa  211  9e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  35.39 
 
 
316 aa  210  2e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  34.95 
 
 
315 aa  208  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  36.21 
 
 
319 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  33.66 
 
 
316 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  37.22 
 
 
310 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1325  malate dehydrogenase (NAD)  36.36 
 
 
307 aa  206  5e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000416686  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  33.99 
 
 
317 aa  205  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  33.99 
 
 
317 aa  205  8e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  35.22 
 
 
310 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  35.1 
 
 
309 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  33.88 
 
 
329 aa  202  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  35.29 
 
 
316 aa  201  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  35.97 
 
 
311 aa  198  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1232  L-lactate dehydrogenase  35.28 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00828905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  34.1 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  31.51 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  33.11 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  34.74 
 
 
307 aa  196  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  35.41 
 
 
312 aa  195  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  32.13 
 
 
318 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  33.88 
 
 
319 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  33.88 
 
 
319 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1552  malate dehydrogenase (NAD)  34.29 
 
 
314 aa  193  4e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2352  L-lactate dehydrogenase  33.22 
 
 
309 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0365594  normal  0.0145977 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0128  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  34.42 
 
 
305 aa  192  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000555723  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0553  malate dehydrogenase (NAD)  34.94 
 
 
304 aa  190  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.270119  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  34.19 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  33.54 
 
 
323 aa  190  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0054  Lactate/malate dehydrogenase  37.38 
 
 
322 aa  189  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  34.3 
 
 
308 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  33.44 
 
 
320 aa  186  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1903  malate dehydrogenase (NAD)  33.66 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0510  malate dehydrogenase (NAD)  37.86 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  32.69 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  32.24 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  33.44 
 
 
310 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  33.77 
 
 
312 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1203  L-lactate dehydrogenase  33.97 
 
 
313 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  33.86 
 
 
310 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21510  Putative membrane-bound L-lactate-quinone oxidoreductase  29.41 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  31.92 
 
 
332 aa  179  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1540  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  33.55 
 
 
302 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  31.02 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0663  lactate/malate dehydrogenase, NAD binding domain protein  34.2 
 
 
304 aa  179  7e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0694  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  33.77 
 
 
315 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>