More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2253 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
318 aa  649    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  55.48 
 
 
317 aa  363  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  55.34 
 
 
316 aa  362  6e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  54.37 
 
 
314 aa  349  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  51.78 
 
 
311 aa  341  8e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  51.97 
 
 
314 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  51.38 
 
 
316 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  50.17 
 
 
322 aa  319  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  49.67 
 
 
317 aa  315  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  49.67 
 
 
317 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1522  L-lactate dehydrogenase  51.92 
 
 
310 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0323488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  46.08 
 
 
321 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  49.18 
 
 
317 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  48.38 
 
 
318 aa  308  5e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  48.71 
 
 
317 aa  309  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  48.87 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  48.06 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  46.65 
 
 
319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  45.75 
 
 
325 aa  298  8e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  47.73 
 
 
328 aa  295  7e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  47 
 
 
309 aa  295  8e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  43.55 
 
 
311 aa  294  1e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  44.23 
 
 
314 aa  292  6e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  46.08 
 
 
323 aa  291  7e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  48.06 
 
 
315 aa  291  8e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  45.05 
 
 
318 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  46.41 
 
 
319 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  44.41 
 
 
314 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  44.41 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  48.57 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  45.57 
 
 
310 aa  285  8e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  44.09 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  44.09 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  44.09 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  44.09 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  44.09 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  44.09 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  44.09 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  44.09 
 
 
314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  46.28 
 
 
329 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  44.92 
 
 
317 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  44.09 
 
 
315 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  44.92 
 
 
317 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  45.81 
 
 
319 aa  281  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  43.13 
 
 
314 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  43.13 
 
 
314 aa  279  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  43.13 
 
 
314 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  43.13 
 
 
314 aa  279  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  43.13 
 
 
314 aa  279  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  43.13 
 
 
314 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  43.13 
 
 
314 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  43.13 
 
 
314 aa  278  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  44.41 
 
 
324 aa  276  4e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1203  L-lactate dehydrogenase  42.44 
 
 
313 aa  273  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  45.81 
 
 
319 aa  273  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  43.37 
 
 
316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  46.77 
 
 
313 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  46.33 
 
 
312 aa  272  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  42.81 
 
 
314 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  42.17 
 
 
314 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2352  L-lactate dehydrogenase  47.85 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0365594  normal  0.0145977 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  42.49 
 
 
314 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  42.68 
 
 
313 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  43.69 
 
 
320 aa  268  1e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  40.88 
 
 
316 aa  261  1e-68  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  41.67 
 
 
320 aa  259  4e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  41.56 
 
 
307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  44.41 
 
 
320 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  43.55 
 
 
319 aa  256  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  41.25 
 
 
310 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  42.48 
 
 
332 aa  246  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3978  malate dehydrogenase (NAD)  40.95 
 
 
315 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  42.26 
 
 
319 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  42.26 
 
 
319 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  41.29 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1299  lactate/malate dehydrogenase  41.06 
 
 
309 aa  242  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1116  L-lactate dehydrogenase  41.31 
 
 
317 aa  242  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0119464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  38.02 
 
 
316 aa  241  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23050  malate dehydrogenase (NAD)  43.39 
 
 
331 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697126  normal  0.046368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  37.66 
 
 
316 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  37.91 
 
 
316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  37.91 
 
 
316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  37.91 
 
 
316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  37.91 
 
 
316 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1564  L-lactate dehydrogenase  39.87 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  hitchhiker  0.00299399 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  37.91 
 
 
316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  37.91 
 
 
401 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  37.91 
 
 
316 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  37.91 
 
 
316 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  37.91 
 
 
316 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  39.29 
 
 
310 aa  238  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  39.68 
 
 
312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21510  Putative membrane-bound L-lactate-quinone oxidoreductase  40.75 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0439  L-lactate dehydrogenase  40.45 
 
 
328 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1746  Lactate/malate dehydrogenase  37.82 
 
 
317 aa  227  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.591048  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  37.54 
 
 
317 aa  224  2e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0307  L-lactate dehydrogenase  38.02 
 
 
344 aa  222  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.251867 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  38.66 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2434  L-lactate dehydrogenase  38.66 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167349  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  36.28 
 
 
325 aa  218  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>