More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1117 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
325 aa  664    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  49.68 
 
 
401 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  50.97 
 
 
316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  50.65 
 
 
316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  50.65 
 
 
316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  50.65 
 
 
316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  50.65 
 
 
316 aa  339  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  50.65 
 
 
316 aa  339  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  50.97 
 
 
316 aa  339  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  50.8 
 
 
316 aa  339  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  50.48 
 
 
316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  50.48 
 
 
316 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  46.82 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  47.6 
 
 
315 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 
314 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 
314 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 
314 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  44.9 
 
 
314 aa  297  1e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  45.51 
 
 
314 aa  293  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  45.51 
 
 
314 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  45.51 
 
 
314 aa  293  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  45.51 
 
 
314 aa  293  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  45.51 
 
 
314 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  45.51 
 
 
314 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  45.51 
 
 
314 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  45.51 
 
 
314 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  45.19 
 
 
314 aa  288  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  44.3 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  42.9 
 
 
319 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  45.51 
 
 
314 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  44.87 
 
 
314 aa  278  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  43.05 
 
 
317 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  39.68 
 
 
322 aa  270  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  43.69 
 
 
314 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  40.52 
 
 
323 aa  268  1e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  42.24 
 
 
317 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  42.24 
 
 
317 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  43.13 
 
 
319 aa  265  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  43.18 
 
 
316 aa  263  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  40.31 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  39.94 
 
 
317 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  39.74 
 
 
311 aa  251  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  39.94 
 
 
317 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  40.82 
 
 
329 aa  249  4e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1232  L-lactate dehydrogenase  38.69 
 
 
319 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  39.87 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  38.46 
 
 
325 aa  241  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  40.39 
 
 
318 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  38.41 
 
 
316 aa  241  2e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  40.26 
 
 
341 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  38.83 
 
 
316 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  40.65 
 
 
317 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  40.13 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  41.1 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  41.1 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  37.54 
 
 
311 aa  232  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  37.74 
 
 
318 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  37.85 
 
 
323 aa  228  8e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  36.98 
 
 
307 aa  227  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  38.91 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  36.13 
 
 
317 aa  226  6e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  37.42 
 
 
317 aa  225  7e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  36.08 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  37.25 
 
 
321 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  36.84 
 
 
312 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  35.99 
 
 
310 aa  217  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  37.82 
 
 
335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  35.14 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  35.81 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  35.35 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  36.25 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  36.69 
 
 
320 aa  212  7e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  35.57 
 
 
322 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 
315 aa  210  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  36.42 
 
 
331 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  36.31 
 
 
317 aa  208  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  35.16 
 
 
313 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  36.28 
 
 
318 aa  206  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  35.18 
 
 
314 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  36.33 
 
 
308 aa  204  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  35.46 
 
 
319 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1116  L-lactate dehydrogenase  35.92 
 
 
317 aa  202  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0119464  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  34.52 
 
 
332 aa  202  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0194  malate dehydrogenase (NAD)  35.24 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000257978  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23050  malate dehydrogenase (NAD)  35.84 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697126  normal  0.046368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2352  L-lactate dehydrogenase  34.95 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0365594  normal  0.0145977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3978  malate dehydrogenase (NAD)  33.87 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1232  L-lactate dehydrogenase  33.99 
 
 
315 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00828905  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  34.98 
 
 
320 aa  192  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1564  L-lactate dehydrogenase  35.39 
 
 
334 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  hitchhiker  0.00299399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2434  L-lactate dehydrogenase  34.19 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167349  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1522  L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
310 aa  188  9e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0323488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  33.23 
 
 
313 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>