More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3778 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 331 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  51.45 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  49.68 
 
 		 316 aa  316  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  48.88 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  48.2 
 
 		 317 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  48.2 
 
 		 317 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  47.77 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  48.87 
 
 		 311 aa  295  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  49.01 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  48.34 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  48.34 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  48.34 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  48.34 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  48.34 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  48.34 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  48.34 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  45.78 
 
 		 321 aa  293  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  49.01 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  48.34 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  48.34 
 
 		 314 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  48.49 
 
 		 322 aa  289  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  44.23 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  45.74 
 
 		 314 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  44.84 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  46.01 
 
 		 317 aa  285  9e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  46.25 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  48.11 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  46.86 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  44.84 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  43.95 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1116  L-lactate dehydrogenase  44.94 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0119464  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  46.77 
 
 		 316 aa  279  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  47.6 
 
 		 317 aa  279  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  47.6 
 
 		 317 aa  279  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  47.02 
 
 		 314 aa  278  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  46.36 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  46.69 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  46.69 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  46.69 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  46.69 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  46.69 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  46.69 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  46.69 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  45.57 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  48.57 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  46.95 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  43.51 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  43.37 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  43.93 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  45.05 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  46.69 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  46.2 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  44.55 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  47.02 
 
 		 314 aa  269  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  43.59 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  44.9 
 
 		 315 aa  269  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  42.22 
 
 		 318 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  43.65 
 
 		 307 aa  262  6e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  42.58 
 
 		 311 aa  261  2e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  40.06 
 
 		 332 aa  259  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  43.93 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  42.53 
 
 		 323 aa  256  5e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1522  L-lactate dehydrogenase  44.44 
 
 		 310 aa  255  9e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0323488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  46.79 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  46.79 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  42.77 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  44.19 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  45.9 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  42.86 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1564  L-lactate dehydrogenase  39.75 
 
 		 334 aa  252  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  hitchhiker  0.00299399 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  43.18 
 
 		 310 aa  252  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2434  L-lactate dehydrogenase  38.39 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167349  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2352  L-lactate dehydrogenase  42.62 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0365594  normal  0.0145977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23050  malate dehydrogenase (NAD)  40.61 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697126  normal  0.046368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  41.64 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21510  Putative membrane-bound L-lactate-quinone oxidoreductase  41.33 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1203  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  42.19 
 
 		 309 aa  238  6.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3978  malate dehydrogenase (NAD)  41.16 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  41.86 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1746  Lactate/malate dehydrogenase  37.99 
 
 		 317 aa  235  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.591048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  39.49 
 
 		 316 aa  235  9e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  39.49 
 
 		 316 aa  235  9e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  39.49 
 
 		 316 aa  235  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  39.49 
 
 		 316 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  39.62 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  39.62 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  39.62 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0382  malate dehydrogenase (NAD)  39.7 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277292  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0370  malate dehydrogenase (NAD)  39.7 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0237216  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0391  malate dehydrogenase (NAD)  39.7 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  39.17 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  39.3 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  38.98 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  39.3 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0439  L-lactate dehydrogenase  40 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0307  L-lactate dehydrogenase  38.75 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.251867 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  39.87 
 
 		 308 aa  222  9e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1299  lactate/malate dehydrogenase  37.54 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  38.17 
 
 		 317 aa  215  7e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>