More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1540 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1540  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 302 aa  618  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0194  malate dehydrogenase (NAD)  45.97 
 
 		 310 aa  269  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000257978  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0128  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  42.52 
 
 		 305 aa  268  7e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000555723  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1903  malate dehydrogenase (NAD)  46.05 
 
 		 316 aa  264  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0663  lactate/malate dehydrogenase, NAD binding domain protein  45.97 
 
 		 304 aa  259  6e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1325  malate dehydrogenase (NAD)  43.38 
 
 		 307 aa  255  7e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000416686  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1552  malate dehydrogenase (NAD)  41.67 
 
 		 314 aa  249  3e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0694  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  41 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0553  malate dehydrogenase (NAD)  41.67 
 
 		 304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.270119  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0510  malate dehydrogenase (NAD)  45.07 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0076  malate dehydrogenase (NAD)  43.9 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  38.34 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  37.82 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1394  malate dehydrogenase (NAD)  36.18 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1232  L-lactate dehydrogenase  35.62 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  32.8 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 		 401 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  35.9 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  31.83 
 
 		 316 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  31.61 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  31.83 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  33.12 
 
 		 341 aa  175  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  35.69 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  32.48 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0054  Lactate/malate dehydrogenase  36.33 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  32.68 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  29.81 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  29.81 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  29.81 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  29.81 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  29.81 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  29.81 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  29.81 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  29.49 
 
 		 314 aa  165  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  29.49 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  33.44 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  29.71 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  29.17 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  29.17 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  32.69 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  32.49 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  32.18 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  31.73 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  29.17 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  29.17 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  29.17 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  29.17 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  29.17 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  29.17 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  29.17 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  32.06 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  31.45 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  28.85 
 
 		 314 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1301  L-lactate dehydrogenase  32.36 
 
 		 308 aa  158  8e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.123994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  30.1 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1182  L-lactate dehydrogenase  31.72 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  32.06 
 
 		 311 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  32.9 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  30.23 
 
 		 318 aa  155  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  30.62 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  30.62 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  32.59 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  30.98 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  30.74 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  31.49 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  31.72 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  28.21 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  28.21 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  30.67 
 
 		 319 aa  149  8e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  30.07 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  28.85 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  30.52 
 
 		 325 aa  145  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  30.25 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  29.71 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  28.85 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  30.35 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  30.03 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1232  L-lactate dehydrogenase  28.8 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00828905  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  30.29 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  29.84 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1203  L-lactate dehydrogenase  29.34 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  29.49 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000852  L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125875  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  29.58 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05842  hypothetical protein similar to L-lactate dehydrogenase (Eurofung)  26.85 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  29.9 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  29.24 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  32.78 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>