More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000852 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000852  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 317 aa  649    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125875  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0325  Lactate/malate dehydrogenase  42.66 
 
 		 309 aa  241  7.999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.242446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  40.26 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  38.71 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  37.3 
 
 		 316 aa  205  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  38.01 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  38.01 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  34.07 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  36.45 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  34.84 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  32.36 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  35.48 
 
 		 311 aa  185  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  34.52 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  33.99 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  34.07 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  35.19 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  33.55 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  36.24 
 
 		 335 aa  179  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  33.23 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  33.88 
 
 		 313 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  34.36 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  34.36 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  34.36 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  34.36 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  34.36 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  34.36 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  34.36 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  33.67 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  31.73 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  34.02 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  34.47 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  35.16 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1522  L-lactate dehydrogenase  36.71 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0323488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  34.02 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  32.26 
 
 		 319 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1203  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2352  L-lactate dehydrogenase  36.81 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0365594  normal  0.0145977 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  32.69 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3978  malate dehydrogenase (NAD)  35.5 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0307  L-lactate dehydrogenase  34.29 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.251867 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  31.72 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1116  L-lactate dehydrogenase  36.52 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0119464  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  34.38 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  33.11 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  31.86 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  31.76 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  31.63 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  34.25 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  34.29 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  34.39 
 
 		 314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0439  L-lactate dehydrogenase  33.97 
 
 		 328 aa  165  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  31.75 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  33.11 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  31.31 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  32.27 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  30.62 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  32.55 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  32.76 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  32.76 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  32.76 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  32.76 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  32.76 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  32.76 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  31.7 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  32.76 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  33.98 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1564  L-lactate dehydrogenase  31.94 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  hitchhiker  0.00299399 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  33.44 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  33.81 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  32.03 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  30.94 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  31.63 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1232  L-lactate dehydrogenase  32.31 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  33.57 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  31.48 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  31.29 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  31.29 
 
 		 401 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  31.29 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  31.29 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  31.29 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  31.48 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  31.29 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  30.85 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  30.13 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2802  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.97 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  31.63 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  32.59 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  31.21 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1746  Lactate/malate dehydrogenase  30.7 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.591048  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0382  malate dehydrogenase (NAD)  33.33 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0391  malate dehydrogenase (NAD)  33.33 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0370  malate dehydrogenase (NAD)  33.33 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0237216  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  29.45 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0194  malate dehydrogenase (NAD)  31.39 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000257978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.82 
 
 		 320 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>