295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1301 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1301  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
308 aa  624  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.123994  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1182  L-lactate dehydrogenase  99.03 
 
 
308 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0565  L-lactate dehydrogenase  97.69 
 
 
260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.447507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  35.08 
 
 
341 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  35.37 
 
 
316 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  35.9 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  35.58 
 
 
316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  35.58 
 
 
316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  35.58 
 
 
316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  35.78 
 
 
316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  35.58 
 
 
316 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  35.58 
 
 
316 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  35.9 
 
 
316 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  35.58 
 
 
401 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  35.05 
 
 
316 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  34.11 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  35.41 
 
 
324 aa  178  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1903  malate dehydrogenase (NAD)  32.69 
 
 
316 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0194  malate dehydrogenase (NAD)  34.87 
 
 
310 aa  176  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000257978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1232  L-lactate dehydrogenase  31.39 
 
 
319 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 
325 aa  172  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0510  malate dehydrogenase (NAD)  36.72 
 
 
304 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 
328 aa  169  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 
318 aa  167  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1325  malate dehydrogenase (NAD)  35.55 
 
 
307 aa  168  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000416686  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  31.33 
 
 
314 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 
322 aa  166  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  30.26 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  34.07 
 
 
318 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  35.24 
 
 
314 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  165  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  31.61 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  32.91 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 
329 aa  163  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  33.23 
 
 
314 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  31.39 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  32.25 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0128  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  32.35 
 
 
305 aa  162  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000555723  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  32.17 
 
 
325 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  33.44 
 
 
310 aa  161  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  32.38 
 
 
314 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  32.9 
 
 
311 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  32.48 
 
 
311 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  32.06 
 
 
314 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  32.06 
 
 
314 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  32.06 
 
 
314 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  32.06 
 
 
314 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  32.06 
 
 
314 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  32.06 
 
 
314 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  32.06 
 
 
314 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1540  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  32.36 
 
 
302 aa  158  9e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0663  lactate/malate dehydrogenase, NAD binding domain protein  33.44 
 
 
304 aa  158  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  31.75 
 
 
314 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0054  Lactate/malate dehydrogenase  34.42 
 
 
322 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1552  malate dehydrogenase (NAD)  33.89 
 
 
314 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0553  malate dehydrogenase (NAD)  34.67 
 
 
304 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.270119  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  34.11 
 
 
313 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  29.81 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  30.1 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  31.51 
 
 
317 aa  152  5e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0076  malate dehydrogenase (NAD)  34.39 
 
 
304 aa  152  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  32.25 
 
 
314 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  29.64 
 
 
309 aa  150  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  31.75 
 
 
317 aa  150  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  31.77 
 
 
309 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  31.29 
 
 
335 aa  149  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  29.55 
 
 
317 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  30.35 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  33.44 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21510  Putative membrane-bound L-lactate-quinone oxidoreductase  28.05 
 
 
328 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  28.97 
 
 
316 aa  145  6e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  31.61 
 
 
319 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  31.01 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  30.99 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  30.25 
 
 
323 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  28.03 
 
 
318 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3978  malate dehydrogenase (NAD)  26.84 
 
 
315 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  29.9 
 
 
318 aa  142  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  28.2 
 
 
320 aa  142  9e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1232  L-lactate dehydrogenase  30.1 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00828905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  31.29 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0694  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  31.8 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  29.84 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  27.1 
 
 
319 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  27.1 
 
 
319 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  30.52 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1564  L-lactate dehydrogenase  28.94 
 
 
334 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  hitchhiker  0.00299399 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  28.9 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  29.71 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  28.21 
 
 
317 aa  139  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  28.29 
 
 
317 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>