296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0076 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0076  malate dehydrogenase (NAD)  100 
 
 
304 aa  610  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0510  malate dehydrogenase (NAD)  53.51 
 
 
304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0194  malate dehydrogenase (NAD)  49.83 
 
 
310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000257978  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1325  malate dehydrogenase (NAD)  49.17 
 
 
307 aa  295  6e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000416686  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0553  malate dehydrogenase (NAD)  46.2 
 
 
304 aa  291  9e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.270119  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0663  lactate/malate dehydrogenase, NAD binding domain protein  47.52 
 
 
304 aa  288  9e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1903  malate dehydrogenase (NAD)  46.82 
 
 
316 aa  276  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1552  malate dehydrogenase (NAD)  46.2 
 
 
314 aa  271  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0694  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  46.15 
 
 
315 aa  259  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0128  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  47.1 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000555723  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1540  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  44.52 
 
 
302 aa  249  4e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  36.3 
 
 
318 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  37.62 
 
 
322 aa  190  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 
401 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1232  L-lactate dehydrogenase  35.5 
 
 
319 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 
316 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  35.67 
 
 
316 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 
316 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 
316 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 
316 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 
316 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 
316 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 
316 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 
316 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 
316 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  35.2 
 
 
325 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  32.05 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  32.28 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  32.27 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  34.54 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  34.54 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1301  L-lactate dehydrogenase  35.55 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.123994  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1182  L-lactate dehydrogenase  34.88 
 
 
308 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  31.8 
 
 
314 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  34.6 
 
 
324 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  30.84 
 
 
341 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  31.63 
 
 
315 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  31.68 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  33.65 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  34.53 
 
 
315 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  32.9 
 
 
307 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  31.6 
 
 
317 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  34.71 
 
 
314 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  30.13 
 
 
314 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  30.13 
 
 
314 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  30.13 
 
 
314 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  30.13 
 
 
314 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  30.13 
 
 
314 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  30.13 
 
 
314 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  31.58 
 
 
312 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  33.11 
 
 
314 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  30.13 
 
 
314 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  30.13 
 
 
314 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  30.62 
 
 
309 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  30.03 
 
 
317 aa  157  2e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  32.67 
 
 
310 aa  156  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  31.21 
 
 
316 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  29.52 
 
 
314 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  31.05 
 
 
318 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  30.94 
 
 
331 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  30.32 
 
 
317 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 
319 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  31.17 
 
 
318 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  31.15 
 
 
311 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  31.15 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  32.58 
 
 
323 aa  153  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  31.15 
 
 
310 aa  151  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  30.07 
 
 
323 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  31.48 
 
 
328 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  28.85 
 
 
319 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 
311 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  31.92 
 
 
319 aa  149  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  30.84 
 
 
309 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1394  malate dehydrogenase (NAD)  30.4 
 
 
307 aa  149  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  32.35 
 
 
321 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  31.67 
 
 
314 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  32.43 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  31.32 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  30.1 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  30.43 
 
 
325 aa  147  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1203  L-lactate dehydrogenase  31.41 
 
 
313 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0054  Lactate/malate dehydrogenase  33.01 
 
 
322 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  28.8 
 
 
317 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  29.61 
 
 
316 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 
319 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  28.95 
 
 
332 aa  143  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  31.46 
 
 
312 aa  142  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1232  L-lactate dehydrogenase  29.57 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00828905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  29.18 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  30.38 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  27.69 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  29.18 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>