295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0054 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0054  Lactate/malate dehydrogenase  100 
 
 		 322 aa  663    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  37.38 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0194  malate dehydrogenase (NAD)  35.18 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000257978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1232  L-lactate dehydrogenase  37.03 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1903  malate dehydrogenase (NAD)  35.26 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1540  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  36.66 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1325  malate dehydrogenase (NAD)  33.88 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000416686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  34.95 
 
 		 341 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0663  lactate/malate dehydrogenase, NAD binding domain protein  32.13 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1301  L-lactate dehydrogenase  34.42 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.123994  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1182  L-lactate dehydrogenase  34.42 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  34.8 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  32.17 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0128  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  30.99 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000555723  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  29.35 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  29.77 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  32.46 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  30.19 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1552  malate dehydrogenase (NAD)  28.9 
 
 		 314 aa  149  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3978  malate dehydrogenase (NAD)  30.45 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  29.94 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  30.75 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  30.32 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  30.23 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  32.58 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1232  L-lactate dehydrogenase  31.6 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00828905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1564  L-lactate dehydrogenase  32.19 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  hitchhiker  0.00299399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  32.23 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  30.57 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  30.49 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  31.63 
 
 		 319 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  29.45 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  31.21 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  31.27 
 
 		 310 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  30.49 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  30.49 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  30.49 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  30.49 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  30.49 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  30.49 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  30.49 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  30.49 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  31.15 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  31.15 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  31.15 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  31.15 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  31.15 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  32.44 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  31.15 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  31.15 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  31.15 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0553  malate dehydrogenase (NAD)  30.39 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.270119  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0076  malate dehydrogenase (NAD)  32.65 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  29.68 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21510  Putative membrane-bound L-lactate-quinone oxidoreductase  32.23 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  28.76 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0510  malate dehydrogenase (NAD)  31.07 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  30.57 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  30.55 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  31.31 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  29.77 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  30.16 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  29.51 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  32.56 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  33.88 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2434  L-lactate dehydrogenase  30.06 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167349  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  28.53 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  28.21 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  31.95 
 
 		 310 aa  139  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  31.17 
 
 		 319 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  30.49 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  29.81 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  27.56 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  27.56 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  27.56 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  27.56 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  27.56 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  27.56 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  27.56 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  30.25 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  30.67 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  27.88 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  31.56 
 
 		 314 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  29.58 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  27.88 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  29.51 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0694  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  29.81 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  31.11 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  28.75 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  31.21 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  30.77 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  30.77 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  28.71 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  29.69 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  28.12 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0565  L-lactate dehydrogenase  35.12 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.447507  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000852  L-lactate dehydrogenase  30.03 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125875  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0370  malate dehydrogenase (NAD)  30.23 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0237216  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0391  malate dehydrogenase (NAD)  30.23 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>