More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1232 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1232  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 315 aa  633  1e-180  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00828905  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  44.55 
 
 		 316 aa  265  5.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  45.51 
 
 		 319 aa  261  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  45.51 
 
 		 319 aa  261  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  43.23 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  41.97 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  43.75 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  43.75 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  41.5 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  41.5 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  41.5 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  41.5 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  41.5 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  41.5 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  41.5 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  41.5 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  41.83 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  41.83 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  41.83 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  41.83 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  41.83 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  41.83 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  41.83 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  41.5 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  41.83 
 
 		 314 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  41.06 
 
 		 314 aa  238  8e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  41.88 
 
 		 314 aa  238  9e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  42.95 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  40.2 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  40.13 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  42.62 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  39.87 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  38.94 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  42.53 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  41.06 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  39.4 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  41.83 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  40.13 
 
 		 319 aa  226  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  41.5 
 
 		 314 aa  225  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  37.83 
 
 		 317 aa  219  7e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  38.08 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  36.98 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  38 
 
 		 316 aa  215  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  36.33 
 
 		 317 aa  215  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  38.74 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  37 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  37.37 
 
 		 401 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  37 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  37 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  37 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  37 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  36.67 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  35.18 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  36.98 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  36.33 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1232  L-lactate dehydrogenase  38.1 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  36.42 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  40.19 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  35.74 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  34.85 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  33.87 
 
 		 341 aa  198  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  35.28 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  36.42 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2352  L-lactate dehydrogenase  36.27 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0365594  normal  0.0145977 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf109  L-lactate dehydrogenase  34.49 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0268317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  34.65 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  34.74 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  33.99 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  34.67 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  34.78 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  35.22 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16140  L-lactate dehydrogenase  34.47 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0169576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  33.86 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  32.79 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  33.89 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  33.67 
 
 		 335 aa  186  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  33.77 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  34.44 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  35.86 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  31.95 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  32.24 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  36.21 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 		 318 aa  179  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1522  L-lactate dehydrogenase  35.31 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0323488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  30.84 
 
 		 318 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  35.08 
 
 		 314 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  36.54 
 
 		 319 aa  172  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  32.35 
 
 		 331 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  34.94 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  34.32 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1203  L-lactate dehydrogenase  32.03 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2434  L-lactate dehydrogenase  31.16 
 
 		 325 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167349  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1116  L-lactate dehydrogenase  30.16 
 
 		 317 aa  162  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0119464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  33.23 
 
 		 312 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>