More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0694 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0694  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  100 
 
 
315 aa  643    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0128  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  59.27 
 
 
305 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000555723  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0194  malate dehydrogenase (NAD)  56.86 
 
 
310 aa  350  1e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000257978  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1325  malate dehydrogenase (NAD)  54.25 
 
 
307 aa  338  5.9999999999999996e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000416686  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1552  malate dehydrogenase (NAD)  48.87 
 
 
314 aa  316  4e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1903  malate dehydrogenase (NAD)  50.33 
 
 
316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0663  lactate/malate dehydrogenase, NAD binding domain protein  51.83 
 
 
304 aa  306  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0553  malate dehydrogenase (NAD)  41.53 
 
 
304 aa  249  5e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.270119  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1540  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  41 
 
 
302 aa  247  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0076  malate dehydrogenase (NAD)  45.61 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0510  malate dehydrogenase (NAD)  41.86 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  36.89 
 
 
318 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  33.77 
 
 
322 aa  178  9e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  32.46 
 
 
315 aa  175  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  32.69 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  31.73 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  32.05 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  31.73 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  31.73 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  31.73 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1232  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  32.04 
 
 
401 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  32.9 
 
 
316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  31.73 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  31.73 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  31.73 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  30.91 
 
 
325 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  32.37 
 
 
316 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  32.46 
 
 
319 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  33.76 
 
 
317 aa  170  3e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  31.89 
 
 
325 aa  169  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  31.91 
 
 
314 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  32.24 
 
 
317 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  34.07 
 
 
317 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  33.44 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  30.59 
 
 
314 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1394  malate dehydrogenase (NAD)  35.16 
 
 
307 aa  166  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  30.92 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  33.66 
 
 
313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  30.92 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  32.81 
 
 
317 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  32.26 
 
 
311 aa  163  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  29.84 
 
 
341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  31.35 
 
 
319 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  31.35 
 
 
319 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  32.38 
 
 
314 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  31.11 
 
 
319 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  32.03 
 
 
314 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  30.84 
 
 
319 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  34.89 
 
 
323 aa  159  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  32.29 
 
 
328 aa  157  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  29.68 
 
 
317 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  29.68 
 
 
317 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  31.33 
 
 
316 aa  155  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  33.44 
 
 
324 aa  152  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  32.08 
 
 
329 aa  152  7e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  32.03 
 
 
320 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  30.65 
 
 
311 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2253  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 
318 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  31.49 
 
 
312 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  28.85 
 
 
314 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  31.39 
 
 
314 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  30.84 
 
 
319 aa  149  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  27.96 
 
 
309 aa  149  6e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 
331 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  30.16 
 
 
323 aa  149  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  31.63 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  31.8 
 
 
313 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  30.46 
 
 
307 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  28.16 
 
 
310 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  29.74 
 
 
317 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  30 
 
 
310 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  31.15 
 
 
316 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  27.97 
 
 
332 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1203  L-lactate dehydrogenase  30.13 
 
 
313 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1182  L-lactate dehydrogenase  32.13 
 
 
308 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1301  L-lactate dehydrogenase  31.8 
 
 
308 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.123994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  30.42 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  30.94 
 
 
310 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  31.46 
 
 
309 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf109  L-lactate dehydrogenase  28.89 
 
 
320 aa  137  2e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0268317  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  30.35 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  29.32 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  28.75 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  29.19 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>