More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0338 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  100 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  45.9 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0612  malate dehydrogenase  45.21 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000109591 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1509  malate dehydrogenase  45.54 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.195418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1675  malate dehydrogenase  45.54 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0291374  normal  0.817536 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1699  malate dehydrogenase  45.45 
 
 		 309 aa  275  7e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000446484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  43.85 
 
 		 308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.89 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.9 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  41.12 
 
 		 309 aa  265  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  45.03 
 
 		 321 aa  265  7e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41.14 
 
 		 316 aa  264  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  42.67 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1571  malate dehydrogenase  45.85 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000156495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  40.86 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  40.85 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  41.83 
 
 		 317 aa  258  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  41.75 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  40.92 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  40.4 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  41.86 
 
 		 310 aa  256  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  42.24 
 
 		 320 aa  256  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  40.92 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  40.45 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  41.91 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  41.75 
 
 		 320 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  42.24 
 
 		 320 aa  256  5e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  40.06 
 
 		 320 aa  255  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  42.24 
 
 		 320 aa  255  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  41.25 
 
 		 321 aa  254  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  39.8 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39.16 
 
 		 320 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  40.74 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  42.33 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  39.48 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  40.52 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  41.25 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41.42 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  42.57 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41.41 
 
 		 312 aa  248  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  40.07 
 
 		 320 aa  248  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  39.54 
 
 		 317 aa  248  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.27 
 
 		 311 aa  248  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  41.42 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  40.59 
 
 		 312 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  40.2 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39.81 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39.81 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  42.24 
 
 		 320 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  42.24 
 
 		 320 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  40.92 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  41.91 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  39.27 
 
 		 320 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  41.25 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  40.07 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  39.02 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3604  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41.58 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  39.93 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  39.27 
 
 		 312 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  41.78 
 
 		 310 aa  245  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1140  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.53 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208998  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  40.07 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  39.22 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  39.81 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  38.41 
 
 		 312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.26 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  42.76 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  39.87 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 309 aa  242  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39.74 
 
 		 320 aa  242  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  38.41 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  38.41 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  38.41 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  38.41 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  38.41 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  38.41 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  38.41 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  38.36 
 
 		 316 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  38.41 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  38.41 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  40.74 
 
 		 312 aa  241  9e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  41.33 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  38.08 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  38.03 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0419  malate dehydrogenase  39.6 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  38.03 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5970  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41.41 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284223  normal  0.475687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  38.89 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2501  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.448823 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  38.56 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  39.4 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  39.4 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  38.94 
 
 		 312 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  38.94 
 
 		 312 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  38.24 
 
 		 321 aa  237  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  37.54 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  40.79 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  38.75 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  39.73 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>