More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0610 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0610  malate dehydrogenase  100 
 
 
313 aa  629  1e-179  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0959  malate dehydrogenase  62.42 
 
 
314 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1548  malate dehydrogenase  61.46 
 
 
314 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1669  malate dehydrogenase  61.46 
 
 
314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0936564  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0244  malate dehydrogenase  61.15 
 
 
314 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2343  malate dehydrogenase  42.44 
 
 
317 aa  250  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0492  malate dehydrogenase  44.55 
 
 
332 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2444  malate dehydrogenase  42.36 
 
 
317 aa  242  5e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2590  malate dehydrogenase  44.59 
 
 
318 aa  241  9e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.662548  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1271  malate dehydrogenase  39.02 
 
 
319 aa  222  6e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.845217  normal  0.680295 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  35.46 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  36.83 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  36.39 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  36.18 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  34.81 
 
 
310 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  35.9 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  36.83 
 
 
319 aa  168  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  34.63 
 
 
310 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  34.97 
 
 
314 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  36.69 
 
 
308 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  36.72 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  33.86 
 
 
332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  33.99 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  34.19 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  34.2 
 
 
309 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  35.85 
 
 
310 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1299  lactate/malate dehydrogenase  30.82 
 
 
309 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  33.88 
 
 
312 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  34.95 
 
 
314 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  34.3 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  34.3 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  34.3 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  34.3 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  34.3 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  34.3 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  34.3 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.08 
 
 
311 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1746  Lactate/malate dehydrogenase  31.95 
 
 
317 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.591048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  34.3 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  34.3 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  33.98 
 
 
312 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 
314 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 
314 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 
314 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 
314 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 
314 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 
314 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 
314 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.65 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.74 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  33.22 
 
 
312 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  33.86 
 
 
324 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  33.65 
 
 
309 aa  155  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  32.9 
 
 
315 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  36.97 
 
 
314 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  33.23 
 
 
314 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  33.66 
 
 
309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.27 
 
 
320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  32.28 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  30.16 
 
 
320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  32.7 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  32.79 
 
 
310 aa  151  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  33.01 
 
 
322 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  30.09 
 
 
315 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  31.43 
 
 
311 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2802  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.01 
 
 
311 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0612  malate dehydrogenase  33.01 
 
 
309 aa  150  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000000109591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.25 
 
 
309 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  34.2 
 
 
308 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  36.39 
 
 
311 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  35.86 
 
 
314 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  35.86 
 
 
314 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  35.86 
 
 
314 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  35.86 
 
 
314 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  35.86 
 
 
314 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  35.86 
 
 
314 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  35.86 
 
 
314 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2377  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.49 
 
 
307 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.379215  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  35.62 
 
 
307 aa  148  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  34.06 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  35.86 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  34.2 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  35.86 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  32.08 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  34.81 
 
 
332 aa  146  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  31.73 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  31.31 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  32.58 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  32.39 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  31.63 
 
 
312 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32 
 
 
312 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  30.19 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.25 
 
 
313 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  34.56 
 
 
311 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  32.47 
 
 
320 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  34.6 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.91 
 
 
320 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.91 
 
 
320 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  34.38 
 
 
314 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  28.75 
 
 
320 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>