More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0612 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0612  malate dehydrogenase  100 
 
 		 309 aa  618  1e-176  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000109591 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1571  malate dehydrogenase  89.94 
 
 		 309 aa  555  1e-157  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000156495 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1699  malate dehydrogenase  84.14 
 
 		 309 aa  546  1e-154  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000446484 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1509  malate dehydrogenase  84.74 
 
 		 308 aa  545  1e-154  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.195418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1675  malate dehydrogenase  61.17 
 
 		 309 aa  421  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0291374  normal  0.817536 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  45.21 
 
 		 304 aa  280  3e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.72 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  43.23 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  41.5 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  40.33 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.33 
 
 		 333 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0864  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343298 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0428  malate dehydrogenase  39.14 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0451  malate dehydrogenase  38.49 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  41.28 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41.61 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_393  malate dehydrogenase, NAD-dependent  38.16 
 
 		 308 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.871516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39.47 
 
 		 309 aa  245  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  40.32 
 
 		 321 aa  245  6.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  38.71 
 
 		 316 aa  245  8e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  40.6 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  41.58 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  41.39 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  41.53 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.91 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.33 
 
 		 313 aa  242  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  40.4 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  39.94 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  41.03 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  40.67 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  42.24 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  40.71 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  41.64 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  38.96 
 
 		 321 aa  238  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  39.74 
 
 		 312 aa  238  8e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  40.07 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  40.07 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  40.07 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  40.07 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  40.07 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1140  malate dehydrogenase, NAD-dependent  38.82 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208998  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  40.07 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  40.07 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  41.31 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  40.07 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  40.07 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  35.62 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  39.67 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.27 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.27 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  40.98 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  39.34 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  39.74 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  41.25 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  41.25 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  38.61 
 
 		 314 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  37 
 
 		 310 aa  235  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  40.38 
 
 		 317 aa  235  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  39.94 
 
 		 322 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  39.55 
 
 		 316 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  39.93 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  38.61 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  39.27 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  40.66 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  39.34 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  39.02 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  39.74 
 
 		 317 aa  232  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.5 
 
 		 316 aa  232  5e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  40 
 
 		 321 aa  232  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  38.24 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  39.23 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  39.23 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  37.62 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  39.23 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0392  malate dehydrogenase  40 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.208989 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  38.69 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  39.6 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  39.94 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  40.32 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  40.33 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  41.78 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  38.46 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0419  malate dehydrogenase  40 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  40.72 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39.68 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39.68 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5970  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40 
 
 		 310 aa  228  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284223  normal  0.475687 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  38.24 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  40.26 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08746  malate dehydrogenase  36.12 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  40.26 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2802  malate dehydrogenase, NAD-dependent  38.28 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  40.33 
 
 		 320 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  37.66 
 
 		 320 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  38.56 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  40.06 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2377  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.379215  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  40 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  37.01 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0641  malate dehydrogenase  39.29 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>