More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2590 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2590  malate dehydrogenase  100 
 
 		 318 aa  648    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.662548  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2444  malate dehydrogenase  67.09 
 
 		 317 aa  437  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2343  malate dehydrogenase  65.41 
 
 		 317 aa  428  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0492  malate dehydrogenase  66.35 
 
 		 332 aa  426  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1271  malate dehydrogenase  53.63 
 
 		 319 aa  345  7e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.845217  normal  0.680295 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1669  malate dehydrogenase  42.3 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0936564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0959  malate dehydrogenase  42.62 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0244  malate dehydrogenase  41.97 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1548  malate dehydrogenase  43.09 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0610  malate dehydrogenase  44.59 
 
 		 313 aa  241  9e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  34.84 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  36.36 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  33.44 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  34.52 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  33.65 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  33.44 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  35.48 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  37.76 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  34.84 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  34.84 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  34.74 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  35.16 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  33.76 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  35.9 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  35.16 
 
 		 320 aa  159  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1116  L-lactate dehydrogenase  38.78 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0119464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  35.08 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  32.59 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  32.03 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  38.67 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  35.22 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  34.41 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2434  L-lactate dehydrogenase  32.8 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167349  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  37.3 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23050  malate dehydrogenase (NAD)  36.69 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697126  normal  0.046368 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  29.9 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.6 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  31.45 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  33.23 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  38.82 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  31.25 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  33.65 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  33.65 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  35.74 
 
 		 319 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21510  Putative membrane-bound L-lactate-quinone oxidoreductase  35.8 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1564  L-lactate dehydrogenase  35.63 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  hitchhiker  0.00299399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  31.72 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.69 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  31.48 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  31.51 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  32.17 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  30.84 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  32.58 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  31.73 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  30.79 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.58 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  33.66 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  30.52 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  31.7 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  31.66 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  31.63 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.86 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1746  Lactate/malate dehydrogenase  33.11 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.591048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  30.19 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  31.01 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  29.87 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  33.6 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  29.87 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  30.74 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  28.57 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  30.74 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  30.74 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  29.87 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  30.74 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  29.87 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  30.74 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  30.74 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  30.74 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  29.87 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  30.16 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  30.74 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  29.87 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  30.74 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>