More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1669 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1669  malate dehydrogenase  100 
 
 		 314 aa  633    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0936564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0244  malate dehydrogenase  99.04 
 
 		 314 aa  628  1e-179  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0959  malate dehydrogenase  94.27 
 
 		 314 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1548  malate dehydrogenase  76.43 
 
 		 314 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0610  malate dehydrogenase  61.46 
 
 		 313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2343  malate dehydrogenase  43.81 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0492  malate dehydrogenase  43.73 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2590  malate dehydrogenase  42.3 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.662548  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2444  malate dehydrogenase  41.31 
 
 		 317 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1271  malate dehydrogenase  37.91 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.845217  normal  0.680295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  36.91 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  35.62 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  36.25 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  37.62 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  34.07 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  36.68 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  37.46 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  34.7 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  36.28 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  36.04 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  36.1 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  36.1 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  36.1 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  36.1 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  36.1 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  36.1 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  36.1 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  36.1 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  35.78 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  36.1 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  33.65 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  34.62 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  36.92 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  35.5 
 
 		 308 aa  168  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  36.27 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  35.03 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  34.7 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  35.13 
 
 		 314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  36.36 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  36.6 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.81 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  33.74 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  36.6 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1299  lactate/malate dehydrogenase  31.02 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  30.55 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  33.75 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  33.65 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  34.48 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  32.81 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  33.65 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.34 
 
 		 320 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  33.44 
 
 		 320 aa  152  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  35.31 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  30.99 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  33.97 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  33.12 
 
 		 320 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  33.96 
 
 		 320 aa  148  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  33.54 
 
 		 320 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  33.75 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  33.23 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  34.29 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  29.91 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  33.33 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  29.74 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.12 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  30.07 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  30.07 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  30.07 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  30.07 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  30.07 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  30.07 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  33.75 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  30.07 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  34.18 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  32.47 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  31.73 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  32.35 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.27 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.14 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  32.82 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  32.4 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.3 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  32.1 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  32.1 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  32.1 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  32.1 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  32.1 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  32.1 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  32.1 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.97 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  33.69 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.17 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  32.47 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  33.12 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  31.19 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  33.97 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1746  Lactate/malate dehydrogenase  32.09 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.591048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  33.97 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2377  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.91 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.379215  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  33.23 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>