More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2343 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2343  malate dehydrogenase  100 
 
 		 317 aa  645    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0492  malate dehydrogenase  65.71 
 
 		 332 aa  436  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2590  malate dehydrogenase  65.41 
 
 		 318 aa  428  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.662548  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2444  malate dehydrogenase  64.44 
 
 		 317 aa  426  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1271  malate dehydrogenase  59.55 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.845217  normal  0.680295 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0959  malate dehydrogenase  45.08 
 
 		 314 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1669  malate dehydrogenase  43.81 
 
 		 314 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0936564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0244  malate dehydrogenase  43.81 
 
 		 314 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1548  malate dehydrogenase  44.09 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0610  malate dehydrogenase  42.44 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  33.97 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  35.94 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  35.82 
 
 		 319 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  36.81 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  35.37 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  37.41 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  37.59 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  36.16 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  36.16 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  36.16 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  36.16 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  36.16 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23050  malate dehydrogenase (NAD)  40.08 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697126  normal  0.046368 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  36.16 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  34.8 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  36.16 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  36.16 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  35.99 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  36.16 
 
 		 314 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  36.53 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  35.83 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  34.94 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  35.13 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  37.69 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  32.91 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  34.97 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  34.97 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  34.97 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  34.97 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  34.97 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  34.97 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  34.97 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  34.97 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  37.62 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  34.52 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  36.52 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  32.69 
 
 		 307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  35.71 
 
 		 332 aa  165  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  34.08 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  33.66 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2434  L-lactate dehydrogenase  35.61 
 
 		 325 aa  162  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167349  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  33.44 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  34.5 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1746  Lactate/malate dehydrogenase  33.12 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.591048  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  35.49 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  32.8 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  31.95 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  34.19 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.81 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  30 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  31.63 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1299  lactate/malate dehydrogenase  31.94 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  33.55 
 
 		 320 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.5 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21510  Putative membrane-bound L-lactate-quinone oxidoreductase  35.89 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1116  L-lactate dehydrogenase  41.04 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0119464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.65 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  34.86 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  37.04 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  36.69 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  34.63 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2352  L-lactate dehydrogenase  34.03 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0365594  normal  0.0145977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  31.8 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  34.19 
 
 		 308 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  31.06 
 
 		 332 aa  152  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  34.58 
 
 		 316 aa  152  7e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  32.57 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  32.51 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  33.21 
 
 		 310 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1564  L-lactate dehydrogenase  35.02 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  hitchhiker  0.00299399 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.7 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  32.35 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.13 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  32.57 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  31.66 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.42 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.9 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0687  malate dehydrogenase  33.77 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663685  normal  0.0260965 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.5 
 
 		 311 aa  148  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  34.57 
 
 		 317 aa  148  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>