More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58454 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_58454  predicted protein  100 
 
 		 809 aa  1651    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0929212 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06316  ATP-binding protein (Eurofung)  39.11 
 
 		 1228 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_432  predicted protein  34.44 
 
 		 829 aa  251  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0880854  normal  0.487842 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02500  ATPase, putative  33.7 
 
 		 939 aa  230  7e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.791376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  32.01 
 
 		 603 aa  178  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  33.99 
 
 		 586 aa  174  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  33.43 
 
 		 730 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  30.75 
 
 		 605 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  29.76 
 
 		 605 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  30.9 
 
 		 631 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  31.42 
 
 		 692 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  33.81 
 
 		 645 aa  161  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  29.65 
 
 		 622 aa  160  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  31.48 
 
 		 590 aa  159  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  30.36 
 
 		 566 aa  159  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  33.24 
 
 		 584 aa  158  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  32.73 
 
 		 557 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  32.66 
 
 		 669 aa  157  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  33.04 
 
 		 640 aa  157  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  33.16 
 
 		 644 aa  157  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  30.94 
 
 		 626 aa  156  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  30.79 
 
 		 565 aa  156  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.74 
 
 		 649 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  29.76 
 
 		 566 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  28.44 
 
 		 612 aa  154  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 647 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  31.96 
 
 		 626 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  31.71 
 
 		 755 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 647 aa  154  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  31.62 
 
 		 647 aa  154  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 647 aa  154  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 647 aa  154  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 626 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  31.46 
 
 		 647 aa  153  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 626 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  32.71 
 
 		 644 aa  153  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  31.62 
 
 		 647 aa  153  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  29.17 
 
 		 566 aa  152  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  27.6 
 
 		 620 aa  152  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  31.63 
 
 		 639 aa  151  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  33.53 
 
 		 659 aa  150  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  30.5 
 
 		 643 aa  150  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  35.5 
 
 		 608 aa  150  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 		 647 aa  150  7e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  31.03 
 
 		 644 aa  150  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  26.63 
 
 		 687 aa  150  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  29.63 
 
 		 611 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 644 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14607  predicted protein  27.95 
 
 		 337 aa  149  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  31.61 
 
 		 695 aa  149  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  28.37 
 
 		 615 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  31.08 
 
 		 559 aa  148  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  27.09 
 
 		 698 aa  148  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  32 
 
 		 626 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89086  predicted protein  29.21 
 
 		 736 aa  147  7.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  29.61 
 
 		 628 aa  147  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  29.15 
 
 		 625 aa  147  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  31.45 
 
 		 600 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  30.41 
 
 		 630 aa  147  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  28.86 
 
 		 657 aa  146  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  31.42 
 
 		 668 aa  146  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  31.13 
 
 		 600 aa  147  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  28.8 
 
 		 636 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  32.83 
 
 		 619 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  29.25 
 
 		 628 aa  146  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  27.7 
 
 		 674 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  29.6 
 
 		 709 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  30.59 
 
 		 585 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  32.92 
 
 		 630 aa  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  29.02 
 
 		 635 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  26.96 
 
 		 644 aa  145  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  28.71 
 
 		 647 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  28.32 
 
 		 612 aa  145  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00126  DNA mismatch repair protein Mlh1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11700)  27.62 
 
 		 744 aa  144  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  27.19 
 
 		 657 aa  144  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  28.44 
 
 		 667 aa  144  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  33.13 
 
 		 588 aa  144  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  28.53 
 
 		 662 aa  144  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  30.94 
 
 		 621 aa  144  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  28.44 
 
 		 667 aa  144  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  28.44 
 
 		 667 aa  144  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  35.5 
 
 		 680 aa  143  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  28.96 
 
 		 603 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 611 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  34.92 
 
 		 665 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  27.59 
 
 		 664 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  28.75 
 
 		 661 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  32.84 
 
 		 674 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  32.93 
 
 		 674 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  28.75 
 
 		 661 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  28.13 
 
 		 661 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  31.05 
 
 		 630 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  28.49 
 
 		 604 aa  142  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  32.12 
 
 		 656 aa  142  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  25.58 
 
 		 660 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2319  DNA mismatch repair protein MutL  29.25 
 
 		 739 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  28.75 
 
 		 684 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  28.75 
 
 		 684 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  28.48 
 
 		 641 aa  141  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  28.75 
 
 		 684 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>