141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43904 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_43904  phytoene desaturase. zeta-carotene desaturase. bacterial-like protein  100 
 
 		 696 aa  1441    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476322  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  30.73 
 
 		 521 aa  213  9e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  26.67 
 
 		 519 aa  179  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  24.42 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  26.08 
 
 		 498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  28.72 
 
 		 525 aa  163  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  28.7 
 
 		 492 aa  162  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  27.16 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  26.76 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  26.44 
 
 		 502 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  26.44 
 
 		 502 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  24.82 
 
 		 500 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  24.56 
 
 		 527 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  26.46 
 
 		 497 aa  146  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  25.99 
 
 		 490 aa  146  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  25.3 
 
 		 505 aa  144  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  25.44 
 
 		 519 aa  144  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25.62 
 
 		 511 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  25.56 
 
 		 506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  25.87 
 
 		 509 aa  137  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  25.13 
 
 		 536 aa  136  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  25.27 
 
 		 494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  24.65 
 
 		 537 aa  134  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  26.83 
 
 		 548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.38 
 
 		 511 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  24.96 
 
 		 553 aa  131  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  22.14 
 
 		 501 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  26.29 
 
 		 530 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  25.96 
 
 		 504 aa  130  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  26.42 
 
 		 530 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.48 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  25.72 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.38 
 
 		 511 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  26.04 
 
 		 512 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  26.04 
 
 		 512 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  26.42 
 
 		 530 aa  127  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  25.29 
 
 		 552 aa  127  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  26 
 
 		 512 aa  127  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  24.62 
 
 		 492 aa  127  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  26.53 
 
 		 507 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  24.96 
 
 		 504 aa  127  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  25.08 
 
 		 542 aa  126  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  23.39 
 
 		 511 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  22.02 
 
 		 497 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  26.11 
 
 		 504 aa  124  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  22.93 
 
 		 488 aa  123  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  24.25 
 
 		 492 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.48 
 
 		 492 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  25.34 
 
 		 532 aa  122  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  25.58 
 
 		 529 aa  122  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  25.31 
 
 		 508 aa  122  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  25.18 
 
 		 507 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  25.22 
 
 		 493 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  24.3 
 
 		 508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  26.7 
 
 		 489 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  23.16 
 
 		 519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0318  phytoene desaturase  23.2 
 
 		 526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158779  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  24.58 
 
 		 508 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  26.14 
 
 		 506 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  22.45 
 
 		 490 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  23.2 
 
 		 512 aa  110  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  25.59 
 
 		 494 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  27.64 
 
 		 494 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  24.3 
 
 		 508 aa  110  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  23.62 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  24.56 
 
 		 566 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  25.17 
 
 		 531 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  24.49 
 
 		 524 aa  108  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  23.55 
 
 		 512 aa  107  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  21.6 
 
 		 493 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  23.55 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  23.96 
 
 		 498 aa  107  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  21.45 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  25 
 
 		 496 aa  105  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  23.78 
 
 		 495 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  23.56 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  25.41 
 
 		 502 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  24.01 
 
 		 503 aa  100  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2891  phytoene desaturase  24.01 
 
 		 550 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.101189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  23.66 
 
 		 518 aa  99.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  23.77 
 
 		 546 aa  99.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  23.79 
 
 		 492 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  24.16 
 
 		 492 aa  98.6  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  24.48 
 
 		 507 aa  98.6  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  25.7 
 
 		 503 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  23.58 
 
 		 509 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  21.91 
 
 		 511 aa  96.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0470  phytoene desaturase  25.65 
 
 		 496 aa  95.9  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  24.01 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  23.67 
 
 		 518 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  23.67 
 
 		 518 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  22.86 
 
 		 504 aa  94.4  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3491  phytoene desaturase  23.81 
 
 		 551 aa  94  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  24.29 
 
 		 492 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  24.26 
 
 		 502 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  22.82 
 
 		 509 aa  92  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  23.63 
 
 		 552 aa  91.3  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0703  phytoene desaturase  23.93 
 
 		 453 aa  89.7  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.687275  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  21.99 
 
 		 492 aa  89.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  23.22 
 
 		 549 aa  89.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>