More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54331 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_54331  mutl-like protein 1  100 
 
 		 695 aa  1428    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719113  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51248  predicted protein  32.73 
 
 		 722 aa  322  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0753689 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00126  DNA mismatch repair protein Mlh1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11700)  32.62 
 
 		 744 aa  316  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621771  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04630  DNA binding protein, putative  31.61 
 
 		 765 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89086  predicted protein  28.37 
 
 		 736 aa  263  8e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  36.18 
 
 		 559 aa  194  6e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  40.69 
 
 		 620 aa  193  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  38.64 
 
 		 730 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  39.49 
 
 		 630 aa  191  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  35.06 
 
 		 615 aa  187  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  31.57 
 
 		 631 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3769  DNA mismatch repair protein  32.05 
 
 		 630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00256823  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  37.69 
 
 		 628 aa  183  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  39.24 
 
 		 626 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  37.03 
 
 		 644 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  37.32 
 
 		 644 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  37.32 
 
 		 648 aa  183  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  33.84 
 
 		 621 aa  182  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3895  DNA mismatch repair protein  35.61 
 
 		 638 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329435  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3282  DNA mismatch repair protein  34 
 
 		 641 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645074  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  36.11 
 
 		 629 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3027  DNA mismatch repair protein  38.34 
 
 		 650 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0173835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0556  DNA mismatch repair protein  35.33 
 
 		 638 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000137773  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3712  DNA mismatch repair protein  35.33 
 
 		 637 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  35.73 
 
 		 665 aa  181  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3313  DNA mismatch repair protein  36.96 
 
 		 619 aa  181  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0629  DNA mismatch repair protein MutL  38.94 
 
 		 767 aa  181  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  37.65 
 
 		 631 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  38.51 
 
 		 625 aa  180  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  36.77 
 
 		 611 aa  180  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  29.77 
 
 		 622 aa  180  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  39.56 
 
 		 629 aa  180  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  35.06 
 
 		 692 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  36.08 
 
 		 624 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  35.22 
 
 		 661 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  35.88 
 
 		 620 aa  179  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  36.52 
 
 		 624 aa  178  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  34.88 
 
 		 608 aa  178  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  38.22 
 
 		 616 aa  177  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  35.58 
 
 		 661 aa  177  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  34.8 
 
 		 661 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  36.99 
 
 		 612 aa  177  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  37.25 
 
 		 635 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  35.91 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  37.25 
 
 		 635 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  37.25 
 
 		 635 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  36.69 
 
 		 614 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  34.46 
 
 		 623 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  34.5 
 
 		 662 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  32.89 
 
 		 656 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00647  DNA mismatch repair protein  35.57 
 
 		 608 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.893353  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  35.09 
 
 		 669 aa  173  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  33.7 
 
 		 608 aa  173  1e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  36.08 
 
 		 598 aa  173  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  32.62 
 
 		 626 aa  173  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  36.93 
 
 		 634 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  35.76 
 
 		 605 aa  173  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 		 649 aa  173  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  34.5 
 
 		 667 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  34.5 
 
 		 667 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  32.8 
 
 		 645 aa  172  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  34.33 
 
 		 667 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  34.21 
 
 		 661 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  32.94 
 
 		 695 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  35.1 
 
 		 605 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  35.11 
 
 		 669 aa  172  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  34.66 
 
 		 636 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  35.84 
 
 		 641 aa  171  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1030  DNA mismatch repair protein MutL  40.26 
 
 		 560 aa  171  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  33.53 
 
 		 611 aa  171  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  33 
 
 		 633 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 636 aa  170  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  34.94 
 
 		 644 aa  170  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  32.75 
 
 		 633 aa  170  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  36.59 
 
 		 670 aa  170  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  33.84 
 
 		 645 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  36.68 
 
 		 633 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  30.3 
 
 		 589 aa  170  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  32.46 
 
 		 604 aa  170  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  35.99 
 
 		 650 aa  170  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  34.85 
 
 		 647 aa  169  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  37.22 
 
 		 615 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  37.22 
 
 		 615 aa  169  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 652 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  36.68 
 
 		 632 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  34.57 
 
 		 705 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 655 aa  169  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  37.22 
 
 		 615 aa  169  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  37.22 
 
 		 615 aa  169  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  36.23 
 
 		 652 aa  169  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  36.05 
 
 		 632 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  34.76 
 
 		 698 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  37.22 
 
 		 615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  33.84 
 
 		 648 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  37.22 
 
 		 615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  37.22 
 
 		 615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  37.57 
 
 		 653 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  37.22 
 
 		 615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  34.63 
 
 		 557 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  36.08 
 
 		 644 aa  168  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>