95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47077 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47077  predicted protein  100 
 
 
328 aa  682    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0255918  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37667  predicted protein  43.35 
 
 
365 aa  274  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.658602  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49151  predicted protein  39.09 
 
 
345 aa  230  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  24.66 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  25.35 
 
 
285 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  24.14 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  28.4 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  25.59 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  24.92 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  22.99 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  25.09 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  25.86 
 
 
584 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  24.71 
 
 
280 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  22.71 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  34.48 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  22.41 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  23.94 
 
 
295 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  24.17 
 
 
273 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  25.5 
 
 
296 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  22.59 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  21.59 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  21.5 
 
 
292 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  25 
 
 
272 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  25.41 
 
 
285 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  24.15 
 
 
278 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  23.44 
 
 
434 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  28.21 
 
 
287 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  25.89 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  24.84 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  23.28 
 
 
293 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  22.58 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  24.12 
 
 
279 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  21.14 
 
 
328 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  32 
 
 
291 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  26.32 
 
 
284 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.43 
 
 
301 aa  52.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  24.13 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  25.8 
 
 
295 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  23.55 
 
 
294 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  24.36 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  27.54 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  23.34 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  24.35 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  25.48 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  29.69 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  30.7 
 
 
276 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  22.95 
 
 
285 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  29.27 
 
 
284 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  22.66 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  26.9 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  23.98 
 
 
304 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  23.81 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  20.85 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  27.27 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  25.87 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  24.29 
 
 
293 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  27.48 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  26.63 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  26.63 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  25.68 
 
 
282 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00992  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01860)  30.6 
 
 
288 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.961582  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  22.48 
 
 
278 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  22.89 
 
 
280 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  23.14 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  23.15 
 
 
273 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  31.4 
 
 
285 aa  46.6  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  25.66 
 
 
288 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  23.66 
 
 
330 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  28.93 
 
 
283 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  31.4 
 
 
285 aa  46.2  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  23.51 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  22.94 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  30.58 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  26.92 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.85 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  22.03 
 
 
274 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  29.66 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  24.72 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  23.86 
 
 
279 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  23.53 
 
 
283 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  22.97 
 
 
283 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  39.34 
 
 
271 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  23.65 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  24.12 
 
 
280 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  20.93 
 
 
273 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  22.59 
 
 
287 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  22.59 
 
 
287 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  30.77 
 
 
276 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  21.88 
 
 
301 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  23.1 
 
 
287 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03334  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 
328 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.800802  normal  0.618201 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  25.18 
 
 
293 aa  42.7  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  23.2 
 
 
240 aa  42.7  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  23.66 
 
 
294 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0550335 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>