More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46411 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46411  predicted protein  100 
 
 		 467 aa  951    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43657  predicted protein  35.98 
 
 		 425 aa  216  8e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  40.23 
 
 		 271 aa  190  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3329  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  37.65 
 
 		 264 aa  169  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0596791  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.14 
 
 		 531 aa  110  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 		 518 aa  107  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.44 
 
 		 517 aa  106  9e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  31.11 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  30.29 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30 
 
 		 532 aa  103  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  29.61 
 
 		 699 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  30.84 
 
 		 536 aa  103  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  27.17 
 
 		 278 aa  103  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  27.88 
 
 		 308 aa  103  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  28.32 
 
 		 553 aa  103  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  27.9 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  29.96 
 
 		 548 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  28.03 
 
 		 542 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.09 
 
 		 544 aa  98.2  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.94 
 
 		 600 aa  97.8  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  28.57 
 
 		 543 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.13 
 
 		 532 aa  97.8  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  28.19 
 
 		 566 aa  96.7  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  28.05 
 
 		 217 aa  96.3  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  27.27 
 
 		 547 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  26.67 
 
 		 260 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.32 
 
 		 454 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 		 260 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  27.1 
 
 		 543 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 		 260 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  25.96 
 
 		 330 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 		 260 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  25.75 
 
 		 291 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 		 260 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  31 
 
 		 526 aa  94.7  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 		 260 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 		 260 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.09 
 
 		 314 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  29.55 
 
 		 530 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  25 
 
 		 316 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  27.11 
 
 		 260 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.91 
 
 		 530 aa  94.4  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.54 
 
 		 536 aa  94.4  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 		 260 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.91 
 
 		 528 aa  94.4  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 		 260 aa  94  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  27.12 
 
 		 345 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.5 
 
 		 575 aa  94  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.91 
 
 		 530 aa  93.6  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.13 
 
 		 581 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.48 
 
 		 579 aa  92.8  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  25.1 
 
 		 556 aa  92.8  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  25.36 
 
 		 257 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  26.1 
 
 		 246 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  27.48 
 
 		 315 aa  92  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.7 
 
 		 579 aa  91.7  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  27.91 
 
 		 542 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  28.18 
 
 		 537 aa  91.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  27.6 
 
 		 542 aa  91.3  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.44 
 
 		 533 aa  91.3  3e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.15 
 
 		 560 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  26.34 
 
 		 531 aa  91.7  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.15 
 
 		 560 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.15 
 
 		 560 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  25.88 
 
 		 545 aa  91.3  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  28.05 
 
 		 541 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.15 
 
 		 560 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  28.05 
 
 		 541 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  28.05 
 
 		 541 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  28.05 
 
 		 541 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.07 
 
 		 548 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.07 
 
 		 548 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  28.18 
 
 		 536 aa  90.9  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.07 
 
 		 548 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  27.6 
 
 		 541 aa  90.5  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  30.84 
 
 		 549 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.07 
 
 		 548 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.07 
 
 		 548 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  28.05 
 
 		 541 aa  90.5  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  24.78 
 
 		 544 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  26.87 
 
 		 562 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.54 
 
 		 563 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.69 
 
 		 578 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.61 
 
 		 541 aa  90.1  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.44 
 
 		 610 aa  89.7  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.4 
 
 		 616 aa  89.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.44 
 
 		 610 aa  89.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.76 
 
 		 553 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  27.6 
 
 		 541 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  25.32 
 
 		 557 aa  89.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.23 
 
 		 560 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.4 
 
 		 548 aa  89.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  27.17 
 
 		 528 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.87 
 
 		 607 aa  89.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.91 
 
 		 632 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  27.51 
 
 		 223 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  28.05 
 
 		 541 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.03 
 
 		 555 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  27.57 
 
 		 617 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  27.93 
 
 		 541 aa  89  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>