More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4868 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  68.16 
 
 		 647 aa  949    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  68.16 
 
 		 647 aa  949    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  65 
 
 		 647 aa  905    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  100 
 
 		 645 aa  1345    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  65.43 
 
 		 648 aa  882    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.85 
 
 		 643 aa  347  5e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.17 
 
 		 642 aa  346  8e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.73 
 
 		 639 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.83 
 
 		 640 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.67 
 
 		 644 aa  319  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  32.61 
 
 		 639 aa  309  9e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  34.42 
 
 		 811 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  33.33 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  34.58 
 
 		 482 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  35.35 
 
 		 551 aa  127  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  34.56 
 
 		 508 aa  124  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  31.28 
 
 		 481 aa  123  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  31.63 
 
 		 506 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  31.63 
 
 		 506 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  31.16 
 
 		 506 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  30.74 
 
 		 523 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  30.66 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  30.28 
 
 		 508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  33.33 
 
 		 546 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  28.7 
 
 		 519 aa  107  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  29.86 
 
 		 552 aa  95.9  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  25.56 
 
 		 453 aa  88.2  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  26.12 
 
 		 453 aa  87.8  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  25.27 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  26.69 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  26.41 
 
 		 599 aa  84.7  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  24.63 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  27.96 
 
 		 624 aa  80.1  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  28.77 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  24.25 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  24.25 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  29.3 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  27.8 
 
 		 479 aa  77  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  29.8 
 
 		 589 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  27.11 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  28.11 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  26.13 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  28.46 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  28.47 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  27.09 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  27.74 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  28.08 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  25.19 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  27.41 
 
 		 472 aa  70.1  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  27.13 
 
 		 472 aa  70.5  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  27.8 
 
 		 474 aa  70.5  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  27.03 
 
 		 475 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  24.25 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  27.31 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  28.24 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  26.64 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  27.41 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  25.1 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  25.68 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  25.68 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.38 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  25.86 
 
 		 479 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  25.47 
 
 		 500 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  28.19 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  27.97 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  25.76 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  25.67 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  26.48 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  38.96 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  26.64 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  28.8 
 
 		 478 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  36.96 
 
 		 591 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  26.85 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1799  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  38.1 
 
 		 179 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.183814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0385  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  36.44 
 
 		 179 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  32.81 
 
 		 477 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  45 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  25.48 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.08 
 
 		 130 aa  61.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0624  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  55 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.28707  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46657  predicted protein  41.1 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 		 139 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0755  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  31.62 
 
 		 180 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0781  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  31.62 
 
 		 180 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  47.37 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1232  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  36.27 
 
 		 179 aa  59.7  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0571745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  27.75 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  26.85 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3950  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  31.62 
 
 		 180 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  36 
 
 		 139 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  41.94 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 		 130 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  28.3 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  35.85 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.89 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  23.7 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1419  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  31.71 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000338056  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.68 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  36.17 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>