More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3336 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  59.51 
 
 		 627 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  59.51 
 
 		 627 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  84.16 
 
 		 661 aa  1118    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  61.42 
 
 		 607 aa  730    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  53.7 
 
 		 635 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  53.86 
 
 		 634 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  53.86 
 
 		 635 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  56.37 
 
 		 596 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  61.42 
 
 		 607 aa  730    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  100 
 
 		 648 aa  1336    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  61.42 
 
 		 607 aa  730    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  100 
 
 		 648 aa  1336    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  61.42 
 
 		 607 aa  730    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  53.35 
 
 		 554 aa  552  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  55.58 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  49.65 
 
 		 589 aa  541  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  40.87 
 
 		 666 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.37 
 
 		 602 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4730  group II intron, maturase-specific  42.46 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  39.55 
 
 		 568 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  39.69 
 
 		 568 aa  353  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  40.45 
 
 		 585 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  40.07 
 
 		 585 aa  349  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  39.05 
 
 		 549 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  39.58 
 
 		 569 aa  346  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  40.03 
 
 		 561 aa  342  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  39.2 
 
 		 585 aa  332  9e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  38.33 
 
 		 565 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 		 566 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  38.14 
 
 		 553 aa  324  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  43.54 
 
 		 492 aa  323  7e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  39.59 
 
 		 503 aa  320  5e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  37.59 
 
 		 560 aa  320  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  37.59 
 
 		 560 aa  320  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  39.67 
 
 		 495 aa  320  7e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  36.91 
 
 		 571 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 490 aa  316  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 490 aa  316  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 490 aa  316  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 490 aa  316  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.26 
 
 		 548 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.26 
 
 		 548 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.26 
 
 		 548 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.26 
 
 		 548 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.26 
 
 		 548 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  37.18 
 
 		 556 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.26 
 
 		 548 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  65.09 
 
 		 263 aa  313  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  65.09 
 
 		 263 aa  313  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  40.73 
 
 		 495 aa  313  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  38.16 
 
 		 576 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  37.88 
 
 		 576 aa  312  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  37.74 
 
 		 576 aa  312  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  36.09 
 
 		 515 aa  312  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  37.7 
 
 		 592 aa  311  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  41.16 
 
 		 504 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  41.16 
 
 		 504 aa  312  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  41.16 
 
 		 504 aa  312  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  41.16 
 
 		 489 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  38.67 
 
 		 503 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  41.16 
 
 		 489 aa  311  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1119  group II intron, maturase-specific  46.83 
 
 		 338 aa  310  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2438  group II intron, maturase-specific  46.83 
 
 		 338 aa  310  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  41.16 
 
 		 489 aa  310  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  41.16 
 
 		 489 aa  310  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  40.59 
 
 		 490 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  40.59 
 
 		 490 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  40.59 
 
 		 490 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  40.59 
 
 		 490 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  40.59 
 
 		 490 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  40.59 
 
 		 490 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  38.05 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2026  RNA-directed DNA polymerase  60.78 
 
 		 264 aa  306  5.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  38.57 
 
 		 490 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  36.82 
 
 		 544 aa  302  1e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  39.92 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  39.92 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  39.41 
 
 		 490 aa  300  7e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0470  RNA-directed DNA polymerase  63.36 
 
 		 262 aa  297  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  42.51 
 
 		 490 aa  296  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  38.68 
 
 		 490 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  38.88 
 
 		 490 aa  293  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  38.88 
 
 		 490 aa  293  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  38.88 
 
 		 490 aa  293  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  38.57 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  38.57 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  38.57 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  39.11 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  39.11 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  39.11 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  39.28 
 
 		 505 aa  290  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  38.91 
 
 		 490 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  40.94 
 
 		 487 aa  290  8e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  40.5 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.98 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.4 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  34.49 
 
 		 439 aa  192  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  33.56 
 
 		 488 aa  190  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  34.56 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1909  RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)  33.5 
 
 		 443 aa  177  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>