More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1550 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1550  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2912  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  89.16 
 
 		 215 aa  367  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4855  transporter, LysE family  62.14 
 
 		 213 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4781  transporter LysE family  62.14 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.917767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4142  lysine exporter protein LysE/YggA  55.79 
 
 		 211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000225003  hitchhiker  0.0000840644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2400  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.51 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.27 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0862458  normal  0.0704615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2658  lysine exporter protein LysE/YggA  42.41 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3021  amino acid transporter LysE  42.41 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196294  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2800  lysine exporter protein LysE/YggA  40.74 
 
 		 204 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208295  normal  0.25716 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1841  lysine exporter protein LysE/YggA  39.8 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000006365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2724  lysine exporter protein LysE/YggA  39.5 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1905  lysine exporter protein LysE/YggA  39.2 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  36.5 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0042  lysine exporter protein LysE/YggA  39.89 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.44 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.92 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  28.9 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  31.37 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  31.03 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  29.15 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  31.4 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  31.4 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  29.13 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  31.4 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  31.4 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  31.4 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  31.4 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  26.29 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  30.88 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  31.4 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  31.4 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.61 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  31.4 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  32.02 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  32.02 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  28.23 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  29.41 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  30.84 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  31.53 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  29.76 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  25.49 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  31.03 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  32.92 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  32.92 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.95 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  29.48 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  29.47 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.57 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  36.57 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.96 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  29.47 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  29.47 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  29.47 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  29.47 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6117  hypothetical protein  32.14 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.77 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.51 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70510  hypothetical protein  31.63 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  28.65 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  30.41 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  25.85 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  25.22 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4393  lysine exporter protein LysE/YggA  37.43 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  30.61 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  27.13 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  28.72 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  28.19 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.13 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.09 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  27.13 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0834  lysine exporter protein  27.13 
 
 		 209 aa  72  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0107637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.71 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  30.65 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  29.9 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.04 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  29.9 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  27.6 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  28.42 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0699  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  28.35 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  25.6 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.23 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  27.66 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  28.35 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3688  lysine exporter protein LysE/YggA  26.76 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  26.29 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>