286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_67260 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  77.29 
 
 		 513 aa  790    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  67.14 
 
 		 500 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  78.09 
 
 		 513 aa  796    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  76.36 
 
 		 507 aa  756    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  94.51 
 
 		 510 aa  949    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  100 
 
 		 510 aa  1011    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  69.2 
 
 		 523 aa  657    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  74.65 
 
 		 507 aa  741    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5619  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.32 
 
 		 497 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75216  normal  0.2633 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6593  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.62 
 
 		 497 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.783722  normal  0.178286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1825  histidine ammonia-lyase  51.32 
 
 		 549 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5747  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.42 
 
 		 497 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6111  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.42 
 
 		 497 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5836  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  53.08 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  51.52 
 
 		 534 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6911  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  49.18 
 
 		 495 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4838  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  51.52 
 
 		 549 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5918  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  48.04 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  42.54 
 
 		 507 aa  401  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  43.29 
 
 		 511 aa  395  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2586  histidine ammonia-lyase  51.02 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206795  normal  0.158772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0506  histidine ammonia-lyase  48.88 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  40.52 
 
 		 507 aa  388  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  39.59 
 
 		 516 aa  383  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  41 
 
 		 508 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  41.81 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  43.01 
 
 		 508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  44.7 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  44.58 
 
 		 506 aa  353  5.9999999999999994e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4557  histidine ammonia-lyase  43.48 
 
 		 524 aa  351  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.449486  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  41.6 
 
 		 520 aa  350  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  40.52 
 
 		 505 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  44.4 
 
 		 534 aa  350  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0908  histidine ammonia-lyase  44.78 
 
 		 497 aa  346  7e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  42.11 
 
 		 507 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  45.34 
 
 		 517 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  43.55 
 
 		 514 aa  345  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  45.12 
 
 		 508 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  46.64 
 
 		 514 aa  343  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  42.92 
 
 		 510 aa  343  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  41.73 
 
 		 510 aa  343  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  39.23 
 
 		 505 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  39.02 
 
 		 505 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 		 518 aa  342  9e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  39.02 
 
 		 505 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  39.1 
 
 		 505 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  39.02 
 
 		 505 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  39.23 
 
 		 505 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  39.1 
 
 		 505 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  39.02 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  45.21 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  45.04 
 
 		 504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  39.02 
 
 		 505 aa  340  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  43 
 
 		 515 aa  340  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  38.89 
 
 		 505 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  42.17 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  42.17 
 
 		 513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  42.17 
 
 		 513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  42.17 
 
 		 513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 		 514 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  41.51 
 
 		 510 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  41.97 
 
 		 513 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  41.61 
 
 		 526 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  41.62 
 
 		 510 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  44.53 
 
 		 515 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  42.17 
 
 		 513 aa  336  5e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  41.82 
 
 		 510 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  40.95 
 
 		 498 aa  334  2e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  41.77 
 
 		 513 aa  334  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  41.77 
 
 		 513 aa  334  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  45.6 
 
 		 526 aa  333  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  41.77 
 
 		 513 aa  334  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  40.56 
 
 		 514 aa  333  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  42.31 
 
 		 507 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  41.21 
 
 		 510 aa  332  9e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  42.31 
 
 		 507 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  42.83 
 
 		 516 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  40.86 
 
 		 511 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  41.27 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5905  histidine ammonia-lyase  42.31 
 
 		 507 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2172  histidine ammonia-lyase  42.31 
 
 		 507 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  42.54 
 
 		 507 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  41.94 
 
 		 513 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  41.31 
 
 		 519 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  40.49 
 
 		 511 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  44.72 
 
 		 509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  40.45 
 
 		 511 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  42.11 
 
 		 507 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  41.46 
 
 		 511 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  44.17 
 
 		 518 aa  326  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  41.87 
 
 		 511 aa  325  9e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  42.71 
 
 		 518 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  42.92 
 
 		 514 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  43.12 
 
 		 507 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  42.14 
 
 		 507 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  40.86 
 
 		 515 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  41.91 
 
 		 515 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  37.85 
 
 		 504 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  37.85 
 
 		 504 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  41.22 
 
 		 512 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>