259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_15471 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_15471  DNA photolyase-like protein  100 
 
 
382 aa  766    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111669  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1458  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  87.4 
 
 
384 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.89887  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15621  DNA photolyase-like protein  97.64 
 
 
384 aa  750    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.299984  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15221  DNA photolyase-like protein  67.72 
 
 
378 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.408051  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15661  DNA photolyase-like protein  41.32 
 
 
371 aa  282  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.675982  normal  0.652082 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0728  putative DNA photolyase  39.84 
 
 
371 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.947552  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3370  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  34.88 
 
 
410 aa  239  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1389  putative deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.8 
 
 
405 aa  232  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359515  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2809  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  35.12 
 
 
403 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29652  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0617  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  32.14 
 
 
396 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.07426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  36.17 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0011  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  34.57 
 
 
270 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.161683  normal  0.149093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1589  DNA photolyase FAD-binding  31 
 
 
271 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1867  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  32.63 
 
 
293 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107933  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0245  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.68 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0940  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  32.45 
 
 
278 aa  96.3  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0218  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  26.75 
 
 
303 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  27.08 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1383  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.73 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0135788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.52 
 
 
454 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0529  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.63 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0312273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  26.67 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.67 
 
 
476 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  26.67 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  26.67 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1151  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.04 
 
 
452 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1611  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.26 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0778  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  22.27 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4270  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.35 
 
 
473 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397965  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  24.74 
 
 
468 aa  73.2  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  26.15 
 
 
476 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0731  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.56 
 
 
457 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0715  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.56 
 
 
457 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.721475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.41 
 
 
477 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.04 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  25.64 
 
 
476 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0915  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.67 
 
 
477 aa  70.9  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.53 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.08 
 
 
479 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  25.64 
 
 
476 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1386  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.87 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0285292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4047  Deoxyribodipyrimidine photolyase-like  26.02 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00445605  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2244  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.87 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.590626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.62 
 
 
480 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.48 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  24.73 
 
 
469 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3030  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.87 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.334621  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.65 
 
 
469 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.12 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.13 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.62 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.13 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.13 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128536 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1651  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.98 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.12 
 
 
488 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  26.13 
 
 
476 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.75 
 
 
497 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.04 
 
 
492 aa  66.6  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4704  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.96 
 
 
459 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.940834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.87 
 
 
482 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2844  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.91 
 
 
499 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758456  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.44 
 
 
487 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.87 
 
 
477 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.75 
 
 
482 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.5 
 
 
481 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.99 
 
 
470 aa  65.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.4 
 
 
479 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.87 
 
 
486 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2257  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.92 
 
 
442 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03651  putative DNA photolyase  30.53 
 
 
504 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305782  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  25 
 
 
481 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2747  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.26 
 
 
474 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00995843  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.5 
 
 
481 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1134  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.32 
 
 
477 aa  64.3  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172014  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.33 
 
 
474 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.93 
 
 
493 aa  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.51 
 
 
497 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  21.95 
 
 
493 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1380  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.64 
 
 
470 aa  63.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866986  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.27 
 
 
471 aa  63.2  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0813  hypothetical protein  29.65 
 
 
486 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.27 
 
 
475 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0349  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  26.21 
 
 
457 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.723156  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1122  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.67 
 
 
457 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000025981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6799  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.77 
 
 
499 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000114492  decreased coverage  0.000000135491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.26 
 
 
483 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0753  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.16 
 
 
550 aa  62  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0765877  normal  0.622658 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  21.95 
 
 
512 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.9 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  22.44 
 
 
493 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  22.44 
 
 
493 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008740  Maqu_0320  DNA photolyase FAD-binding subunit  28.42 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.37 
 
 
463 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.96 
 
 
499 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.28 
 
 
476 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
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NC_008578  Acel_0151  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.12 
 
 
497 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0953516  normal 
 
 
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NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.07 
 
 
490 aa  60.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.41 
 
 
490 aa  60.8  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.26 
 
 
481 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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