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for query gene Mesil_1386 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1386  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  100 
 
 
435 aa  874    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0285292 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2244  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  68.74 
 
 
433 aa  570  1e-161  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.590626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.07 
 
 
479 aa  259  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3030  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.63 
 
 
451 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.334621  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.88 
 
 
487 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6960  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.03 
 
 
434 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.386716  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.78 
 
 
434 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.32 
 
 
454 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.77 
 
 
488 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10630  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.35 
 
 
450 aa  243  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0061  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.25 
 
 
431 aa  242  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.8 
 
 
484 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4704  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.47 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.940834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.87 
 
 
481 aa  239  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  32.42 
 
 
474 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0778  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.91 
 
 
453 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1921  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.66 
 
 
488 aa  237  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.74 
 
 
469 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.65 
 
 
449 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.35 
 
 
445 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.73 
 
 
491 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.35 
 
 
445 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.35 
 
 
445 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0529  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.85 
 
 
421 aa  236  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0312273  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  32.07 
 
 
471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0906  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.76 
 
 
493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207875  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.52 
 
 
497 aa  233  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2257  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.62 
 
 
442 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  31.86 
 
 
471 aa  233  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  34.9 
 
 
473 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.9 
 
 
472 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.9 
 
 
472 aa  232  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.43 
 
 
481 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.8 
 
 
470 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.9 
 
 
472 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.9 
 
 
481 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.45 
 
 
499 aa  230  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.91 
 
 
482 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.46 
 
 
463 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.62 
 
 
482 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  35.71 
 
 
456 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1958  deoxyribodipyrimidine photolyase (photoreactivating enzyme)  32.95 
 
 
433 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021636 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.48 
 
 
472 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.53 
 
 
472 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.71 
 
 
475 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0029  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.38 
 
 
438 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919202  normal  0.63493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  29.7 
 
 
476 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.53 
 
 
472 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.11 
 
 
477 aa  227  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.24 
 
 
476 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.26 
 
 
488 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.26 
 
 
472 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.88 
 
 
452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.7 
 
 
476 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.88 
 
 
487 aa  226  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  29.76 
 
 
476 aa  226  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.7 
 
 
476 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.75 
 
 
469 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.81 
 
 
453 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.62 
 
 
476 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.68 
 
 
476 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.49 
 
 
476 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.01 
 
 
519 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.01 
 
 
519 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.19 
 
 
487 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.65 
 
 
487 aa  223  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  29.32 
 
 
476 aa  222  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.43 
 
 
484 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11303  deoxyribodipyrimidine photolyase-class I  30 
 
 
434 aa  222  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1364  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.19 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.07 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4249  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.43 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  29.49 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.28 
 
 
493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.63 
 
 
492 aa  221  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.05 
 
 
477 aa  220  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03091  putative DNA photolyase  31.71 
 
 
478 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1122  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.47 
 
 
457 aa  219  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000025981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2196  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.32 
 
 
519 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.41 
 
 
483 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.19 
 
 
497 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.99 
 
 
475 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2087  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.26 
 
 
434 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0527605  normal  0.0533895 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.99 
 
 
490 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0780  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.8 
 
 
475 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431367  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4409  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.91 
 
 
504 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.735576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.2 
 
 
477 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1969  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.86 
 
 
486 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2541  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.77 
 
 
466 aa  216  7e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.272644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.61 
 
 
487 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.91 
 
 
480 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.1 
 
 
468 aa  216  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.19 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.71 
 
 
518 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010676  Bphyt_6799  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.49 
 
 
499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000114492  decreased coverage  0.000000135491 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2095  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.16 
 
 
500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.19 
 
 
492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.91 
 
 
475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.76 
 
 
473 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.55052 
 
 
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NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.05 
 
 
505 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
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