More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2256 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  100 
 
 		 479 aa  951    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  55.65 
 
 		 483 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  57.08 
 
 		 469 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0915  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  56.24 
 
 		 477 aa  461  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2665  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  53.01 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  52.21 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  54.13 
 
 		 478 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  48.12 
 
 		 474 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.89 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1364  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  49.68 
 
 		 473 aa  433  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.63 
 
 		 476 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  49.06 
 
 		 486 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  47.74 
 
 		 490 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  47.9 
 
 		 477 aa  427  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  41.37 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  40.91 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.91 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  40.7 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  40.66 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  45.62 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  46.25 
 
 		 471 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  40.25 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  41.18 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  47.39 
 
 		 483 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  40.66 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  47.69 
 
 		 482 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1562  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  49.47 
 
 		 471 aa  415  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.51951  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  51.45 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2364  deoxyribodipyrimidine photolyase  49.79 
 
 		 487 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  49.37 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1615  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  53.44 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1880  DNA photolyase  47.36 
 
 		 483 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  51.18 
 
 		 519 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.18 
 
 		 519 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  49.26 
 
 		 472 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2747  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  48.44 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00995843  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2095  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.67 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2196  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  50.97 
 
 		 519 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5849  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  46.22 
 
 		 505 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  50 
 
 		 478 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  50 
 
 		 483 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2217  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.88 
 
 		 525 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  50.54 
 
 		 518 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1145  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  48.93 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  48.53 
 
 		 500 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.28 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0729  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  43.24 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  50.22 
 
 		 483 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  48.38 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2677  deoxyribodipyrimidine photolyase  52.29 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2734  deoxyribodipyrimidine photolyase  52.08 
 
 		 486 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.913993  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0636  deoxyribodipyrimidine photolyase  51.88 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2800  deoxyribodipyrimidine photolyase  51.88 
 
 		 486 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2376  deoxyribodipyrimidine photolyase  51.88 
 
 		 486 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2911  deoxyribodipyrimidine photolyase  51.88 
 
 		 534 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1691  deoxyribodipyrimidine photolyase  51.88 
 
 		 486 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  43.34 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  47.3 
 
 		 475 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0813  hypothetical protein  38.05 
 
 		 486 aa  362  9e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1815  deoxyribodipyrimidine photolyase  50.53 
 
 		 486 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496869  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1441  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  44.33 
 
 		 474 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.511514  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  43.34 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.51 
 
 		 487 aa  336  5.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2143  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  44.54 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2318  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.15 
 
 		 476 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1989  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  42.86 
 
 		 468 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.382914  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.61 
 
 		 479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.5 
 
 		 491 aa  323  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0817  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.17 
 
 		 471 aa  323  6e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2125  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.7 
 
 		 479 aa  317  3e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1759  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  43.65 
 
 		 454 aa  307  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0257219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1969  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.43 
 
 		 486 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  41.91 
 
 		 468 aa  302  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.41 
 
 		 472 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.41 
 
 		 472 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.14 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0815  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  43.28 
 
 		 470 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.752894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.02 
 
 		 492 aa  300  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.59 
 
 		 472 aa  299  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  38.59 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.43 
 
 		 488 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.8 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.59 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.45 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.94 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.47 
 
 		 482 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.6 
 
 		 482 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.75 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  40 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.84 
 
 		 470 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.04 
 
 		 475 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0703  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.11 
 
 		 525 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38 
 
 		 463 aa  293  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  38.88 
 
 		 456 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.12 
 
 		 476 aa  292  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.64 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.84 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0769  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.84 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.568717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.17 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.43 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>