186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_00081 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_00081  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.874807  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00081  transcription antitermination protein NusB  94.63 
 
 		 208 aa  390  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0009  transcription antitermination protein NusB  86.34 
 
 		 208 aa  363  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00081  transcription antitermination protein NusB  77.07 
 
 		 208 aa  327  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00081  transcription antitermination protein NusB  50.25 
 
 		 211 aa  207  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00091  transcription antitermination protein NusB  50.74 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0010  transcription antitermination protein NusB  51.72 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.728804  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00081  transcription antitermination protein NusB  50.49 
 
 		 208 aa  191  9e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1336  transcription antitermination protein NusB  50 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0010  transcription antitermination protein NusB  46.8 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  35.92 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  35 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  35 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  33.17 
 
 		 212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  32.34 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  33.5 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  31.16 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  31.86 
 
 		 213 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  41.25 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  36.14 
 
 		 140 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  35.78 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  30.85 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  37.93 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  37.93 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  31.58 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  34.12 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  33 
 
 		 130 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  33 
 
 		 130 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  36.78 
 
 		 142 aa  62  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1032  NusB antitermination factor  41.25 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  33 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  33 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  36.26 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  33 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  33 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  33 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  33 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  30.85 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  33 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  33 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  33 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  30.09 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  33.7 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  38.36 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  38.96 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  33.71 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  32.89 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  31.58 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  32.89 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  32.89 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  39.71 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  32.65 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  34.74 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  34.04 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  40.79 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  32.53 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  29.55 
 
 		 141 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  40.28 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  34.44 
 
 		 134 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  37.84 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  40 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  37.18 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  33.73 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  34.94 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  36.25 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  35.8 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  36.78 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  34.38 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  34.94 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  32.04 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  40.28 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  35.42 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  33.01 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  33.72 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  33.72 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  36.25 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  36.49 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  33.73 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  37.31 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  30.23 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  40.51 
 
 		 143 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  36.36 
 
 		 378 aa  54.3  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  31.03 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 138 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  30.21 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  26.16 
 
 		 325 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  30 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  35.06 
 
 		 147 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  32.56 
 
 		 138 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  35.53 
 
 		 132 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  35 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  37.68 
 
 		 144 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 		 141 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>