More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2556 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 266 aa  530  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  43.07 
 
 		 272 aa  232  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  46.69 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  47.41 
 
 		 264 aa  225  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  45.68 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  45.68 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  42.75 
 
 		 269 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  42.75 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  43.37 
 
 		 279 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  44.86 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 		 267 aa  218  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  41.73 
 
 		 268 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  44 
 
 		 279 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  44.17 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  44.17 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  42.97 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  42.97 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  40.45 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  45.71 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  47.49 
 
 		 266 aa  215  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  45.31 
 
 		 267 aa  215  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  39.54 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  43.8 
 
 		 256 aa  211  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  42.91 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  48.75 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  38.55 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  44.06 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  46.56 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  46.5 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 269 aa  208  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  42.91 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  45.87 
 
 		 261 aa  208  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  45.06 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  41.25 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  43.62 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  45.59 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  39.33 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  39.6 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  40.84 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  43.82 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  46.62 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  45.85 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  47.92 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  47.5 
 
 		 285 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  41.98 
 
 		 278 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 264 aa  205  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 279 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  43.98 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  41.64 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  43.44 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  41.56 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  42.8 
 
 		 276 aa  201  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  46.79 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  41.15 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  45.61 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  43.21 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  39.68 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  40.23 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  39.44 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1255  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 		 267 aa  198  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00504507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1308  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 		 267 aa  198  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519792  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  44.03 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  44.68 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  44.8 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  42.32 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  41.22 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  44.09 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  39.67 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  39.26 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  40.94 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  41.67 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  42.11 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  42.11 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>