208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3151 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  55.51 
 
 
714 aa  742    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  60.62 
 
 
712 aa  765    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  58.88 
 
 
706 aa  785    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  66 
 
 
717 aa  891    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  54.43 
 
 
703 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  54.02 
 
 
703 aa  705    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  59.17 
 
 
714 aa  785    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  57.16 
 
 
714 aa  783    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  62.6 
 
 
723 aa  862    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  57.08 
 
 
708 aa  753    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  58.83 
 
 
734 aa  754    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  58.88 
 
 
706 aa  785    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  54.32 
 
 
694 aa  701    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  63.33 
 
 
582 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  100 
 
 
716 aa  1424    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  50.81 
 
 
685 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  51.78 
 
 
708 aa  616  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  51.29 
 
 
709 aa  609  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  56.73 
 
 
546 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  47.32 
 
 
713 aa  594  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  46.21 
 
 
711 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  48.02 
 
 
713 aa  586  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  47.35 
 
 
706 aa  582  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  50.46 
 
 
687 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  48.81 
 
 
687 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  45 
 
 
717 aa  568  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  49.04 
 
 
687 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  44.76 
 
 
703 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  45.44 
 
 
709 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  51.03 
 
 
577 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  43.19 
 
 
696 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  44.8 
 
 
694 aa  520  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  49.32 
 
 
577 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  41.27 
 
 
759 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  49.13 
 
 
536 aa  425  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  38.96 
 
 
726 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  40.74 
 
 
694 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  36.71 
 
 
715 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  41.11 
 
 
528 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  36.31 
 
 
636 aa  331  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  58 
 
 
369 aa  297  6e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  32.47 
 
 
615 aa  277  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  32.95 
 
 
683 aa  259  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  32.4 
 
 
683 aa  259  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  32.71 
 
 
688 aa  256  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  32.71 
 
 
688 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  31.46 
 
 
645 aa  255  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  31.57 
 
 
684 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  30.53 
 
 
654 aa  250  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  28.55 
 
 
658 aa  247  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  31.57 
 
 
684 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  32.34 
 
 
690 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  32.27 
 
 
679 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  31.21 
 
 
709 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  32.23 
 
 
682 aa  243  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  32.63 
 
 
677 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  30.12 
 
 
751 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  31.84 
 
 
681 aa  238  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  30.38 
 
 
667 aa  233  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  32.59 
 
 
679 aa  230  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  31.85 
 
 
765 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  32.39 
 
 
687 aa  226  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  31.47 
 
 
689 aa  225  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  31.84 
 
 
680 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  31.01 
 
 
740 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  30.83 
 
 
687 aa  218  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  31.31 
 
 
662 aa  210  8e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  31.02 
 
 
662 aa  208  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.63 
 
 
690 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  29.51 
 
 
669 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  31.4 
 
 
692 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  28.9 
 
 
727 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  30.88 
 
 
754 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  28.55 
 
 
623 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  72.31 
 
 
133 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  29.37 
 
 
654 aa  172  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  28.66 
 
 
652 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  26.24 
 
 
624 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  27.41 
 
 
729 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  26.44 
 
 
624 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  27.54 
 
 
654 aa  160  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  25.42 
 
 
624 aa  159  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  25.43 
 
 
626 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  25.43 
 
 
626 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  25.43 
 
 
626 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  25.27 
 
 
624 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  27.33 
 
 
652 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  26.32 
 
 
670 aa  151  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  46.79 
 
 
156 aa  138  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  40.31 
 
 
597 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  28.03 
 
 
623 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  29.24 
 
 
660 aa  121  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  32.9 
 
 
603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  32.73 
 
 
603 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  33.16 
 
 
389 aa  118  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  32.73 
 
 
606 aa  118  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  32.65 
 
 
607 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  30.77 
 
 
595 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  47.2 
 
 
172 aa  112  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  32.56 
 
 
380 aa  111  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>