More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2618 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
333 aa  668    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  66.99 
 
 
336 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  66.34 
 
 
336 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  64.69 
 
 
338 aa  391  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  59.75 
 
 
333 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3940  AraC family transcriptional regulator  55.73 
 
 
366 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.15431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  41.21 
 
 
327 aa  262  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  43.56 
 
 
298 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  46.05 
 
 
307 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 
307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2523  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 
329 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3002  AraC family transcriptional regulator  42.01 
 
 
336 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 
329 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 
324 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1461  transcriptional regulator, AraC family  39.14 
 
 
331 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  35.67 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  35.91 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 
331 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  33.84 
 
 
341 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  34.47 
 
 
319 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  35.67 
 
 
305 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  34.46 
 
 
333 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.45 
 
 
338 aa  159  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  37.26 
 
 
320 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  33.65 
 
 
361 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  36.51 
 
 
314 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  30.41 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 
354 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 
338 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  37.12 
 
 
307 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 
319 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 
338 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 
319 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  33.33 
 
 
311 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  35.93 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  32.93 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 
321 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 
321 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 
321 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 
321 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 
321 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
348 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 
321 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  34.26 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.38 
 
 
358 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
328 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 
333 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  33.23 
 
 
319 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 
334 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 
334 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
387 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 
321 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
321 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  33.23 
 
 
310 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 
348 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  33.13 
 
 
341 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 
336 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  32.76 
 
 
335 aa  142  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  30.75 
 
 
356 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 
341 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  32.83 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  32.83 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 
322 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 
317 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  34.28 
 
 
311 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 
362 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 
325 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  34.24 
 
 
328 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 
317 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  32.15 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 
313 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  30.96 
 
 
320 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  36.12 
 
 
342 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  33.43 
 
 
321 aa  136  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  39.35 
 
 
322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  30.42 
 
 
349 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  33.74 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  32.75 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  31.31 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 
369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>