More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2419 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
385 aa  788    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  61.08 
 
 
388 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  61.33 
 
 
388 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  93.58 
 
 
237 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  93.58 
 
 
237 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  63.03 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  63.99 
 
 
266 aa  355  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  65.79 
 
 
273 aa  347  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0782  NADH dehydrogenase subunit E  74.76 
 
 
225 aa  323  3e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.916923  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  45.02 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  46.38 
 
 
402 aa  302  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  64.04 
 
 
203 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3295  NADH dehydrogenase subunit E  62.69 
 
 
249 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2577  NADH dehydrogenase subunit E  56.3 
 
 
249 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251247  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.89 
 
 
412 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.89 
 
 
412 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2882  NADH dehydrogenase subunit E  52.08 
 
 
249 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.02 
 
 
412 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2406  NADH dehydrogenase subunit E  54.39 
 
 
265 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2216  NADH dehydrogenase subunit E  59.9 
 
 
228 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1883  NADH dehydrogenase subunit E  59.41 
 
 
250 aa  257  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  61.5 
 
 
303 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  59.5 
 
 
303 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  59.5 
 
 
303 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  58 
 
 
398 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  53.6 
 
 
239 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.21 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  56.31 
 
 
228 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.07 
 
 
457 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.72 
 
 
394 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.61 
 
 
208 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.46 
 
 
385 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.59 
 
 
229 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  53.96 
 
 
222 aa  202  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  53.33 
 
 
221 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.29 
 
 
229 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.83 
 
 
222 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.73 
 
 
208 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  43.5 
 
 
239 aa  166  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.63 
 
 
222 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  42.16 
 
 
249 aa  159  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.63 
 
 
216 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  49.35 
 
 
166 aa  155  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0925  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46 
 
 
203 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  40.93 
 
 
270 aa  149  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  41.88 
 
 
260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  40.72 
 
 
181 aa  137  3.0000000000000003e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  42.95 
 
 
181 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  43.23 
 
 
180 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.21 
 
 
161 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.36 
 
 
170 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  36.41 
 
 
217 aa  126  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.51 
 
 
165 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.74 
 
 
163 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.74 
 
 
163 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  41.78 
 
 
174 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  41.78 
 
 
174 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  38.61 
 
 
177 aa  119  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.91 
 
 
166 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  31.7 
 
 
253 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.69 
 
 
164 aa  112  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.31 
 
 
176 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.93 
 
 
170 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  39.58 
 
 
155 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  39.58 
 
 
155 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
168 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  40.97 
 
 
167 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  40.97 
 
 
167 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  40.28 
 
 
167 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  37.58 
 
 
168 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  35.29 
 
 
319 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  40 
 
 
175 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  38.06 
 
 
168 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  27.98 
 
 
230 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  35.71 
 
 
157 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.1 
 
 
176 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.19 
 
 
183 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  40.58 
 
 
161 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  41.6 
 
 
168 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  40.58 
 
 
161 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  40.65 
 
 
158 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  40.58 
 
 
161 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  40.58 
 
 
161 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.22 
 
 
159 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.01 
 
 
166 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  40.58 
 
 
161 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  40.58 
 
 
161 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  40.58 
 
 
161 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  40.58 
 
 
161 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  39.13 
 
 
161 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  33.73 
 
 
273 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  31.15 
 
 
706 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  38.41 
 
 
161 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  31.18 
 
 
305 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  34.44 
 
 
287 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  34.67 
 
 
269 aa  100  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  32.68 
 
 
239 aa  100  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.52 
 
 
165 aa  99.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.48 
 
 
240 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  30.22 
 
 
231 aa  99.8  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>