More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0355 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5346  hypothetical protein  77.26 
 
 
390 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5853  hypothetical protein  82.26 
 
 
390 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6766  hypothetical protein  82.78 
 
 
390 aa  678    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2419  hypothetical protein  76.8 
 
 
390 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.337062 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0355  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  796    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  50 
 
 
868 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3322  hypothetical protein  55.34 
 
 
392 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0572768 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5727  hypothetical protein  50.55 
 
 
395 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0500191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3552  hypothetical protein  49.61 
 
 
383 aa  355  6.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1501  cystathionine gamma-lyase  39.4 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1550  cystathionine gamma-lyase  38.52 
 
 
379 aa  253  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  36.48 
 
 
398 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  38.9 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  36.8 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  38.36 
 
 
392 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  38.63 
 
 
392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  38.63 
 
 
392 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  38.63 
 
 
392 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  38.36 
 
 
392 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  36.75 
 
 
391 aa  232  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  38.17 
 
 
397 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  38.63 
 
 
391 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  38.25 
 
 
392 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  37.77 
 
 
392 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  37.74 
 
 
391 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  35.29 
 
 
393 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  37.74 
 
 
391 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  36.14 
 
 
398 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  36.41 
 
 
398 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  38.62 
 
 
408 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  34.02 
 
 
392 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1630  Cystathionine beta-lyase  36.24 
 
 
386 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  35.49 
 
 
397 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  36.03 
 
 
397 aa  222  8e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  37.23 
 
 
378 aa  222  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  34.46 
 
 
394 aa  222  8e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  37.76 
 
 
391 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  35.09 
 
 
397 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  35.47 
 
 
397 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  35.23 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  38.3 
 
 
392 aa  219  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  37.28 
 
 
390 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  35.2 
 
 
397 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  34.97 
 
 
397 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  35.81 
 
 
401 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  35.43 
 
 
386 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  34.97 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  36.36 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  35.12 
 
 
394 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  35.66 
 
 
396 aa  216  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  34.49 
 
 
390 aa  216  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  34.81 
 
 
397 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  34.17 
 
 
406 aa  216  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  34.22 
 
 
380 aa  215  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  34.22 
 
 
380 aa  215  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  32.89 
 
 
392 aa  215  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  35.13 
 
 
391 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  36.69 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  36.39 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  38.85 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  36.72 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  39.57 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  35.84 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  33.96 
 
 
413 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  35.4 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  33.78 
 
 
376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  33.25 
 
 
390 aa  213  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  37.6 
 
 
393 aa  211  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  35.34 
 
 
392 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  37.28 
 
 
388 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0801  cystathionine gamma-synthase  36.83 
 
 
367 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  31.78 
 
 
397 aa  210  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  37 
 
 
394 aa  210  4e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  37.5 
 
 
378 aa  209  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  34.86 
 
 
407 aa  209  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  34.22 
 
 
423 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  34.31 
 
 
384 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  37.97 
 
 
381 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  34.77 
 
 
407 aa  209  9e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  33.69 
 
 
394 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  36.52 
 
 
380 aa  208  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  35.87 
 
 
390 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  34.97 
 
 
380 aa  208  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  37.11 
 
 
379 aa  208  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  34.22 
 
 
423 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  34.34 
 
 
384 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  35.9 
 
 
396 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  34.31 
 
 
384 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  34.58 
 
 
400 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  33.87 
 
 
393 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  35.53 
 
 
394 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  36.9 
 
 
388 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  35.37 
 
 
386 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.54 
 
 
389 aa  206  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  35.37 
 
 
386 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  35.36 
 
 
386 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  34.38 
 
 
378 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  34.7 
 
 
398 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  34.73 
 
 
382 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  36.19 
 
 
405 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>