More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1691 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1691  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 
290 aa  573  1.0000000000000001e-162  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  39.92 
 
 
280 aa  159  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0546  MscS mechanosensitive ion channel  36.26 
 
 
291 aa  155  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  38.94 
 
 
263 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1410  hypothetical protein  34.05 
 
 
251 aa  126  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 
299 aa  116  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 
303 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  35.33 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 
260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 
288 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 
337 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  35.92 
 
 
286 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  37.56 
 
 
286 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 
356 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0432  small-conductance mechanosensitive channel  33.91 
 
 
298 aa  106  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000493882  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  30.9 
 
 
334 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  40.43 
 
 
454 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 
285 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 
569 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 
442 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 
282 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 
569 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 
278 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  32.69 
 
 
370 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 
285 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  30.99 
 
 
336 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 
299 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 
367 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 
325 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  27.6 
 
 
599 aa  99.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  38.25 
 
 
293 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 
372 aa  99  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  38.25 
 
 
293 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 
388 aa  99  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  32.39 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  32.39 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  32.26 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  32.39 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  32.39 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  32.39 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  32.39 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  32.39 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 
327 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 
871 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 
911 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  33.13 
 
 
344 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 
335 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  30.21 
 
 
455 aa  93.2  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  24.44 
 
 
335 aa  92.8  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 
458 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  36.72 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  30.72 
 
 
336 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 
350 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 
864 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  29.78 
 
 
455 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 
283 aa  90.1  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 
414 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 
293 aa  89.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  38.93 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  28.71 
 
 
884 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 
787 aa  89  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 
858 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 
889 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 
330 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 
822 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 
822 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 
282 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 
822 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  41.84 
 
 
313 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  31.36 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  41.84 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  35.77 
 
 
321 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  32.96 
 
 
747 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  33.16 
 
 
537 aa  83.2  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 
718 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 
707 aa  82.8  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 
550 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 
538 aa  82  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 
719 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 
701 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  25.57 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 
595 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  29.52 
 
 
767 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 
772 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  33.75 
 
 
821 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1100  MscS Mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0753115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  28.97 
 
 
717 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  33.73 
 
 
756 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 
717 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 
715 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>